Showing metabocard for Notoginsenoside A (HMDB0030534)
| Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Version | 5.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Status | Expected but not Quantified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2012-09-11 17:37:28 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2022-03-07 02:52:35 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | HMDB0030534 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Secondary Accession Numbers |
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| Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | Notoginsenoside A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Notoginsenoside A belongs to the class of organic compounds known as triterpenoids. These are terpene molecules containing six isoprene units. Notoginsenoside A is an extremely weak basic (essentially neutral) compound (based on its pKa). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | MOL for HMDB0030534 (Notoginsenoside A)
Mrv0541 05061305192D
78 85 0 0 0 0 999 V2000
-2.5210 -1.2946 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-2.5210 -2.1196 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.8074 -2.5321 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.0952 -2.1196 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.0952 -1.2946 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.8074 -0.8833 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-0.3815 -2.5321 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.3306 -2.1196 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.3306 -1.2946 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-0.3815 -0.8833 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.0416 -0.8833 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.0416 -0.0626 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.3306 0.3472 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-0.3815 -0.0626 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.8212 -1.1365 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.3010 -0.4723 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.8212 0.1891 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.2361 -2.5321 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-2.2200 -3.2472 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.3949 -3.2472 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.0952 -0.4723 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.3306 -0.4723 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.3306 1.1722 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.8212 1.0141 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.0702 1.5342 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.5362 1.4266 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.8212 1.8392 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.2512 1.0141 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.9662 1.4266 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
4.6812 1.0141 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
5.3963 1.4266 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
4.6812 0.1891 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
5.3963 0.6016 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.0416 -1.7084 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.9511 -2.1196 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.2337 2.5542 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.9511 -1.2946 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-4.6661 -0.8833 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-5.3811 -1.2946 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-5.3811 -2.1196 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-4.6661 -2.5321 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.0588 2.5542 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.4712 3.2678 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.0588 3.9814 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.2337 3.9814 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.8212 3.2678 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-4.6661 -3.3572 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-6.0962 -2.5321 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-6.0962 -0.8833 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-4.6661 -0.0626 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-5.3811 0.3554 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-5.3806 -3.7697 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.9961 3.2678 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.8212 4.6964 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.4712 4.6964 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
4.2963 3.2678 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
4.7088 3.9814 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
5.5338 3.9814 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-6.0950 -3.3572 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-6.8095 -3.7697 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-6.8095 -4.5947 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-6.0950 -5.0072 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-5.3806 -4.5947 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
5.9463 3.2678 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
6.7714 3.2678 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
7.1838 3.9814 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
6.7714 4.6964 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
5.9463 4.6964 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-4.6661 -5.0072 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-6.0950 -5.8322 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-7.5240 -5.0072 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-7.5240 -3.3572 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-8.2385 -3.7697 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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7.1838 2.5542 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
8.0089 3.9814 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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77 78 1 0 0 0 0
M END
3D MOL for HMDB0030534 (Notoginsenoside A)HMDB0030534
RDKit 3D
Notoginsenoside A
170177 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000
7.6220 3.6681 -1.9895 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
6.2628 3.5056 -2.6406 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
6.0864 2.0892 -3.0857 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
6.2207 4.3935 -3.7229 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
5.1959 3.8912 -1.7102 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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3.0977 2.5563 0.9160 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.2422 3.2613 1.9513 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.8540 1.5244 1.4465 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
4.6500 1.7601 2.5011 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
5.9811 1.5106 2.1933 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
6.2017 0.2708 1.6512 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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7.8826 -1.0449 0.6202 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
9.1727 -1.1889 0.1686 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
9.2471 -1.4670 -1.1864 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
10.5614 -1.7050 -1.5926 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
10.6710 -1.5656 -3.0763 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
10.3123 -0.2888 -3.5012 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
10.9294 -3.1179 -1.2002 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
12.3178 -3.2060 -0.9604 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
10.1564 -3.4851 0.0354 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
8.9192 -4.0214 -0.2927 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
9.9108 -2.2755 0.9336 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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5.9111 -2.0631 1.9314 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
4.6366 -0.6180 3.3694 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
4.7838 -1.3327 4.5891 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
4.2653 0.7994 3.6179 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
4.9383 1.2276 4.7665 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.2837 1.9744 -0.1943 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.0065 1.2148 -1.2270 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.5725 -0.2076 -0.9454 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.2095 -0.2096 -0.3171 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.4360 -1.0518 0.9652 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.0687 1.1852 0.1724 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-0.1362 1.9473 -0.2879 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.1448 3.3136 -0.5024 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-0.5366 1.4293 -1.6104 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.0330 0.0040 -1.5561 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-2.3763 -0.2238 -0.9403 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.1413 -1.1840 -1.8739 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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C54H92O24
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3D-SDF for HMDB0030534 (Notoginsenoside A)HMDB0030534
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Notoginsenoside A
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PDB for HMDB0030534 (Notoginsenoside A)HEADER PROTEIN 06-MAY-13 NONE TITLE NULL COMPND NULL SOURCE NULL KEYWDS NULL EXPDTA NULL AUTHOR Marvin REVDAT 1 06-MAY-13 0 HETATM 1 C UNK 0 -4.706 -2.417 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 2 C UNK 0 -4.706 -3.957 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 3 C UNK 0 -3.374 -4.727 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 4 C UNK 0 -2.044 -3.957 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 5 C UNK 0 -2.044 -2.417 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 6 C UNK 0 -3.374 -1.649 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 7 C UNK 0 -0.712 -4.727 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 8 C UNK 0 0.617 -3.957 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 9 C UNK 0 0.617 -2.417 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 10 C UNK 0 -0.712 -1.649 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 11 C UNK 0 1.944 -1.649 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 12 C UNK 0 1.944 -0.117 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 13 C UNK 0 0.617 0.648 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 14 C UNK 0 -0.712 -0.117 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 15 C UNK 0 3.400 -2.121 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 16 C UNK 0 4.295 -0.882 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 17 C UNK 0 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-0.693 1.00 0.00 O HETATM 69 C46 UNL 1 -10.786 1.799 -0.356 1.00 0.00 C HETATM 70 O24 UNL 1 -10.670 3.144 -0.712 1.00 0.00 O HETATM 71 C47 UNL 1 -3.439 -1.026 1.245 1.00 0.00 C HETATM 72 C48 UNL 1 -3.018 -0.668 2.702 1.00 0.00 C HETATM 73 C49 UNL 1 -3.987 -2.429 1.453 1.00 0.00 C HETATM 74 C50 UNL 1 -2.249 -0.908 0.400 1.00 0.00 C HETATM 75 C51 UNL 1 -1.561 -2.225 0.198 1.00 0.00 C HETATM 76 C52 UNL 1 -0.329 -2.187 -0.615 1.00 0.00 C HETATM 77 C53 UNL 1 0.114 -0.828 -1.137 1.00 0.00 C HETATM 78 C54 UNL 1 0.807 -1.271 -2.458 1.00 0.00 C HETATM 79 H1 UNL 1 7.957 4.716 -2.050 1.00 0.00 H HETATM 80 H2 UNL 1 7.641 3.259 -0.964 1.00 0.00 H HETATM 81 H3 UNL 1 8.329 3.039 -2.587 1.00 0.00 H HETATM 82 H4 UNL 1 6.312 1.420 -2.226 1.00 0.00 H HETATM 83 H5 UNL 1 6.768 1.876 -3.942 1.00 0.00 H HETATM 84 H6 UNL 1 5.053 1.952 -3.444 1.00 0.00 H HETATM 85 H7 UNL 1 6.023 3.856 -4.527 1.00 0.00 H HETATM 86 H8 UNL 1 4.465 4.657 -1.931 1.00 0.00 H HETATM 87 H9 UNL 1 5.851 2.534 -0.309 1.00 0.00 H HETATM 88 H10 UNL 1 4.585 4.093 1.332 1.00 0.00 H HETATM 89 H11 UNL 1 3.465 4.478 0.033 1.00 0.00 H HETATM 90 H12 UNL 1 1.742 4.109 1.465 1.00 0.00 H HETATM 91 H13 UNL 1 2.972 3.781 2.650 1.00 0.00 H HETATM 92 H14 UNL 1 1.652 2.624 2.592 1.00 0.00 H HETATM 93 H15 UNL 1 4.651 2.809 2.885 1.00 0.00 H HETATM 94 H16 UNL 1 5.563 0.165 0.749 1.00 0.00 H HETATM 95 H17 UNL 1 8.365 0.499 1.933 1.00 0.00 H HETATM 96 H18 UNL 1 7.699 0.933 0.305 1.00 0.00 H HETATM 97 H19 UNL 1 9.760 -0.241 0.344 1.00 0.00 H HETATM 98 H20 UNL 1 11.262 -0.968 -1.138 1.00 0.00 H HETATM 99 H21 UNL 1 11.761 -1.677 -3.338 1.00 0.00 H HETATM 100 H22 UNL 1 10.150 -2.361 -3.623 1.00 0.00 H HETATM 101 H23 UNL 1 10.891 0.351 -2.988 1.00 0.00 H HETATM 102 H24 UNL 1 10.670 -3.784 -2.062 1.00 0.00 H HETATM 103 H25 UNL 1 12.732 -3.523 -1.779 1.00 0.00 H HETATM 104 H26 UNL 1 10.766 -4.191 0.658 1.00 0.00 H HETATM 105 H27 UNL 1 8.642 -3.728 -1.189 1.00 0.00 H HETATM 106 H28 UNL 1 10.864 -1.924 1.357 1.00 0.00 H HETATM 107 H29 UNL 1 8.440 -3.346 1.665 1.00 0.00 H HETATM 108 H30 UNL 1 6.749 -0.886 3.334 1.00 0.00 H HETATM 109 H31 UNL 1 5.023 -2.493 2.012 1.00 0.00 H HETATM 110 H32 UNL 1 3.836 -1.178 2.828 1.00 0.00 H HETATM 111 H33 UNL 1 4.838 -2.300 4.302 1.00 0.00 H HETATM 112 H34 UNL 1 3.161 0.848 3.761 1.00 0.00 H HETATM 113 H35 UNL 1 5.070 0.430 5.352 1.00 0.00 H HETATM 114 H36 UNL 1 1.949 2.923 -0.799 1.00 0.00 H HETATM 115 H37 UNL 1 4.094 1.299 -1.107 1.00 0.00 H HETATM 116 H38 UNL 1 2.822 1.511 -2.282 1.00 0.00 H HETATM 117 H39 UNL 1 3.389 -0.596 -0.254 1.00 0.00 H HETATM 118 H40 UNL 1 2.728 -0.773 -1.845 1.00 0.00 H HETATM 119 H41 UNL 1 0.521 -1.349 1.450 1.00 0.00 H HETATM 120 H42 UNL 1 2.165 -1.855 0.779 1.00 0.00 H HETATM 121 H43 UNL 1 1.938 -0.361 1.670 1.00 0.00 H HETATM 122 H44 UNL 1 0.999 1.254 1.301 1.00 0.00 H HETATM 123 H45 UNL 1 -0.937 2.006 0.474 1.00 0.00 H HETATM 124 H46 UNL 1 -0.630 3.661 -1.007 1.00 0.00 H HETATM 125 H47 UNL 1 -1.118 2.096 -2.261 1.00 0.00 H HETATM 126 H48 UNL 1 0.441 1.327 -2.191 1.00 0.00 H HETATM 127 H49 UNL 1 -1.220 -0.125 -2.681 1.00 0.00 H HETATM 128 H50 UNL 1 -3.805 -0.585 -2.566 1.00 0.00 H HETATM 129 H51 UNL 1 -3.713 -1.939 -1.388 1.00 0.00 H HETATM 130 H52 UNL 1 -2.434 -1.690 -2.578 1.00 0.00 H HETATM 131 H53 UNL 1 -2.747 1.936 -1.090 1.00 0.00 H HETATM 132 H54 UNL 1 -4.132 0.967 -1.523 1.00 0.00 H HETATM 133 H55 UNL 1 -3.120 1.594 1.294 1.00 0.00 H HETATM 134 H56 UNL 1 -4.629 2.010 0.402 1.00 0.00 H HETATM 135 H57 UNL 1 -5.110 0.208 1.923 1.00 0.00 H HETATM 136 H58 UNL 1 -6.850 -0.047 1.549 1.00 0.00 H HETATM 137 H59 UNL 1 -8.979 -2.066 -0.751 1.00 0.00 H HETATM 138 H60 UNL 1 -6.259 -3.427 -1.149 1.00 0.00 H HETATM 139 H61 UNL 1 -7.715 -3.716 -2.132 1.00 0.00 H HETATM 140 H62 UNL 1 -7.090 -4.988 0.035 1.00 0.00 H HETATM 141 H63 UNL 1 -8.339 -1.301 -2.769 1.00 0.00 H HETATM 142 H64 UNL 1 -6.047 -0.967 -3.329 1.00 0.00 H HETATM 143 H65 UNL 1 -6.458 0.720 -2.063 1.00 0.00 H HETATM 144 H66 UNL 1 -9.004 0.433 -2.964 1.00 0.00 H HETATM 145 H67 UNL 1 -7.438 1.654 -0.029 1.00 0.00 H HETATM 146 H68 UNL 1 -8.943 2.207 0.597 1.00 0.00 H HETATM 147 H69 UNL 1 -11.597 0.520 3.029 1.00 0.00 H HETATM 148 H70 UNL 1 -9.995 -1.449 1.333 1.00 0.00 H HETATM 149 H71 UNL 1 -11.355 -1.851 2.431 1.00 0.00 H HETATM 150 H72 UNL 1 -9.168 -1.974 3.315 1.00 0.00 H HETATM 151 H73 UNL 1 -13.162 0.052 1.415 1.00 0.00 H HETATM 152 H74 UNL 1 -12.666 -1.166 -0.228 1.00 0.00 H HETATM 153 H75 UNL 1 -12.347 2.407 1.059 1.00 0.00 H HETATM 154 H76 UNL 1 -13.972 1.305 -0.316 1.00 0.00 H HETATM 155 H77 UNL 1 -10.829 1.204 -1.293 1.00 0.00 H HETATM 156 H78 UNL 1 -11.318 3.719 -0.233 1.00 0.00 H HETATM 157 H79 UNL 1 -3.908 -0.512 3.310 1.00 0.00 H HETATM 158 H80 UNL 1 -2.444 -1.519 3.130 1.00 0.00 H HETATM 159 H81 UNL 1 -2.321 0.188 2.675 1.00 0.00 H HETATM 160 H82 UNL 1 -4.749 -2.300 2.285 1.00 0.00 H HETATM 161 H83 UNL 1 -4.548 -2.848 0.634 1.00 0.00 H HETATM 162 H84 UNL 1 -3.209 -3.046 1.901 1.00 0.00 H HETATM 163 H85 UNL 1 -1.495 -0.256 0.936 1.00 0.00 H HETATM 164 H86 UNL 1 -1.347 -2.760 1.167 1.00 0.00 H HETATM 165 H87 UNL 1 -2.362 -2.907 -0.231 1.00 0.00 H HETATM 166 H88 UNL 1 -0.513 -2.912 -1.468 1.00 0.00 H HETATM 167 H89 UNL 1 0.518 -2.695 -0.079 1.00 0.00 H HETATM 168 H90 UNL 1 1.168 -0.451 -3.047 1.00 0.00 H HETATM 169 H91 UNL 1 -0.091 -1.647 -3.058 1.00 0.00 H HETATM 170 H92 UNL 1 1.394 -2.173 -2.343 1.00 0.00 H CONECT 1 2 79 80 81 CONECT 2 3 4 5 CONECT 3 82 83 84 CONECT 4 85 CONECT 5 6 6 86 CONECT 6 7 87 CONECT 7 8 88 89 CONECT 8 9 10 33 CONECT 9 90 91 92 CONECT 10 11 CONECT 11 12 31 93 CONECT 12 13 CONECT 13 14 27 94 CONECT 14 15 95 96 CONECT 15 16 CONECT 16 17 25 97 CONECT 17 18 CONECT 18 19 21 98 CONECT 19 20 99 100 CONECT 20 101 CONECT 21 22 23 102 CONECT 22 103 CONECT 23 24 25 104 CONECT 24 105 CONECT 25 26 106 CONECT 26 107 CONECT 27 28 29 108 CONECT 28 109 CONECT 29 30 31 110 CONECT 30 111 CONECT 31 32 112 CONECT 32 113 CONECT 33 34 38 114 CONECT 34 35 115 116 CONECT 35 36 117 118 CONECT 36 37 38 77 CONECT 37 119 120 121 CONECT 38 39 122 CONECT 39 40 41 123 CONECT 40 124 CONECT 41 42 125 126 CONECT 42 43 77 127 CONECT 43 44 45 74 CONECT 44 128 129 130 CONECT 45 46 131 132 CONECT 46 47 133 134 CONECT 47 48 71 135 CONECT 48 49 CONECT 49 50 58 136 CONECT 50 51 CONECT 51 52 54 137 CONECT 52 53 138 139 CONECT 53 140 CONECT 54 55 56 141 CONECT 55 142 CONECT 56 57 58 143 CONECT 57 144 CONECT 58 59 145 CONECT 59 60 CONECT 60 61 69 146 CONECT 61 62 CONECT 62 63 65 147 CONECT 63 64 148 149 CONECT 64 150 CONECT 65 66 67 151 CONECT 66 152 CONECT 67 68 69 153 CONECT 68 154 CONECT 69 70 155 CONECT 70 156 CONECT 71 72 73 74 CONECT 72 157 158 159 CONECT 73 160 161 162 CONECT 74 75 163 CONECT 75 76 164 165 CONECT 76 77 166 167 CONECT 77 78 CONECT 78 168 169 170 END SMILES for HMDB0030534 (Notoginsenoside A)CC(C)(O)\C=C\CC(C)(OC1OC(COC2OC(CO)C(O)C(O)C2O)C(O)C(O)C1O)C1CCC2(C)C1C(O)CC1C3(C)CCC(OC4OC(CO)C(O)C(O)C4OC4OC(CO)C(O)C(O)C4O)C(C)(C)C3CCC21C INCHI for HMDB0030534 (Notoginsenoside A)InChI=1S/C54H92O24/c1-49(2,70)13-9-14-54(8,78-47-43(69)39(65)36(62)28(75-47)22-71-45-41(67)37(63)33(59)25(19-55)72-45)23-10-16-53(7)32(23)24(58)18-30-51(5)15-12-31(50(3,4)29(51)11-17-52(30,53)6)76-48-44(40(66)35(61)27(21-57)74-48)77-46-42(68)38(64)34(60)26(20-56)73-46/h9,13,23-48,55-70H,10-12,14-22H2,1-8H3/b13-9+ 3D Structure for HMDB0030534 (Notoginsenoside A) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
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| Chemical Formula | C54H92O24 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Molecular Weight | 1125.2939 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Molecular Weight | 1124.597853872 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | 2-{[(4E)-2-(5-{[4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-{[3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}oxan-2-yl]oxy}-16-hydroxy-2,6,6,10,11-pentamethyltetracyclo[8.7.0.0²,⁷.0¹¹,¹⁵]heptadecan-14-yl)-6-hydroxy-6-methylhept-4-en-2-yl]oxy}-6-({[3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}methyl)oxane-3,4,5-triol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | 2-{[(4E)-2-(5-{[4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-{[3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}oxan-2-yl]oxy}-16-hydroxy-2,6,6,10,11-pentamethyltetracyclo[8.7.0.0²,⁷.0¹¹,¹⁵]heptadecan-14-yl)-6-hydroxy-6-methylhept-4-en-2-yl]oxy}-6-({[3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}methyl)oxane-3,4,5-triol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | 193895-21-5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | CC(C)(O)\C=C\CC(C)(OC1OC(COC2OC(CO)C(O)C(O)C2O)C(O)C(O)C1O)C1CCC2(C)C1C(O)CC1C3(C)CCC(OC4OC(CO)C(O)C(O)C4OC4OC(CO)C(O)C(O)C4O)C(C)(C)C3CCC21C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C54H92O24/c1-49(2,70)13-9-14-54(8,78-47-43(69)39(65)36(62)28(75-47)22-71-45-41(67)37(63)33(59)25(19-55)72-45)23-10-16-53(7)32(23)24(58)18-30-51(5)15-12-31(50(3,4)29(51)11-17-52(30,53)6)76-48-44(40(66)35(61)27(21-57)74-48)77-46-42(68)38(64)34(60)26(20-56)73-46/h9,13,23-48,55-70H,10-12,14-22H2,1-8H3/b13-9+ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | NPZAABKZLIBPQV-UKTHLTGXSA-N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as triterpenoids. These are terpene molecules containing six isoprene units. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Lipids and lipid-like molecules | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Prenol lipids | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Triterpenoids | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Triterpenoids | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Substituents |
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| Molecular Framework | Aliphatic heteropolycyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physiological effect | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disposition | Biological location
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| Process | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Role | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State | Solid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Molecular Properties |
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| Experimental Chromatographic Properties | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Molecular Properties |
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| Predicted Chromatographic Properties | Predicted Collision Cross Sections
Predicted Kovats Retention IndicesNot Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MS/MS Spectra
NMR Spectra
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| Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations |
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| Biospecimen Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathways |
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| Normal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Abnormal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Associated Disorders and Diseases | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disease References | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Associated OMIM IDs | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | FDB002407 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | C00030837 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 131751045 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| VMH ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MarkerDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Good Scents ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References |
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