Showing metabocard for Ginsenoside Ra3 (HMDB0039551)
| Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Version | 5.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Status | Expected but not Quantified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2012-09-12 01:02:43 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2022-03-07 02:56:15 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | HMDB0039551 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Secondary Accession Numbers |
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| Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | Ginsenoside Ra3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Basellasaponin B belongs to the class of organic compounds known as 2,4,5-trisubstituted oxazoles. 2,4,5-trisubstituted oxazoles are compounds containing an oxazole ring substituted at positions 2, 4 and 5 only. Oxazole is a five-membered aromatic heterocycle with one oxygen, one nitrogen, and three carbon atoms. Isomers include 1,2-oxazole and 1,3-oxazole. Basellasaponin B is an extremely weak basic (essentially neutral) compound (based on its pKa). Outside of the human body, Basellasaponin B has been detected, but not quantified in, green vegetables and malabar spinachs. This could make basellasaponin b a potential biomarker for the consumption of these foods. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | MOL for HMDB0039551 (Ginsenoside Ra3)
Mrv0541 05061311132D
86 94 0 0 0 0 999 V2000
4.8770 0.4859 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
4.6501 -0.3073 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.8486 -0.5052 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.6218 -1.2985 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
4.4151 -1.5268 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.6483 -3.9507 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.5551 -3.1310 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.3482 -3.3578 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.8267 -2.7543 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.3565 -2.0918 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.5516 -2.3090 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.8566 -1.8951 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.1363 -2.2966 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.1226 -3.1200 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.8237 -3.5353 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.8308 -2.7070 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.8718 -1.0717 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.8140 -4.3710 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.0937 -4.7697 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.3857 -4.3450 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.4008 -3.5201 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.4146 -2.6966 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
6.2504 0.0928 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
5.6785 0.6852 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
5.9053 1.4785 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-0.3072 -3.0966 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.0275 -3.4953 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.0426 -4.3201 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.7630 -4.7202 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-2.4696 -4.2954 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-2.4573 -3.4706 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.1626 -3.0458 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.1489 -2.2196 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.8555 -1.7962 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.2354 -7.1687 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.9421 -6.7453 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-4.6638 -7.1426 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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-6.7837 -5.8695 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-6.0633 -5.4695 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-5.3553 -5.8957 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-4.6349 -5.4943 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.9283 -5.9204 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.2051 -5.5204 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.1913 -4.6955 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.8994 -4.2707 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.8856 -3.4459 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-4.5924 -3.0223 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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-0.3346 -4.7450 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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2.8300 -1.0717 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.6292 -0.2715 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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3.0238 1.1032 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.6177 1.6751 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.4170 2.4752 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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1.8360 -0.0447 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.6367 0.7568 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.2306 1.3301 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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85 86 1 0 0 0 0
M END
3D MOL for HMDB0039551 (Ginsenoside Ra3)HMDB0039551
RDKit 3D
Ginsenoside Ra3
186194 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000
-7.1721 -1.5269 -3.1509 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-6.1424 -0.4317 -3.2927 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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-14.9734 1.4358 2.6824 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-15.6151 0.2049 2.4940 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-14.6826 2.0102 1.3350 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-15.3618 1.3213 0.3174 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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HETATM 19 O5 UNL 1 -8.491 4.198 -0.325 1.00 0.00 O HETATM 20 C15 UNL 1 -9.518 1.607 -0.038 1.00 0.00 C HETATM 21 O6 UNL 1 -10.226 2.782 -0.213 1.00 0.00 O HETATM 22 C16 UNL 1 -10.147 0.649 0.946 1.00 0.00 C HETATM 23 O7 UNL 1 -11.041 1.398 1.739 1.00 0.00 O HETATM 24 C17 UNL 1 -12.362 1.026 1.464 1.00 0.00 C HETATM 25 O8 UNL 1 -12.876 0.406 2.583 1.00 0.00 O HETATM 26 C18 UNL 1 -13.650 1.219 3.388 1.00 0.00 C HETATM 27 C19 UNL 1 -14.973 1.436 2.682 1.00 0.00 C HETATM 28 O9 UNL 1 -15.615 0.205 2.494 1.00 0.00 O HETATM 29 C20 UNL 1 -14.683 2.010 1.335 1.00 0.00 C HETATM 30 O10 UNL 1 -15.362 1.321 0.317 1.00 0.00 O HETATM 31 C21 UNL 1 -13.212 2.174 1.052 1.00 0.00 C HETATM 32 O11 UNL 1 -12.766 3.335 1.664 1.00 0.00 O HETATM 33 C22 UNL 1 -9.113 -0.045 1.766 1.00 0.00 C HETATM 34 O12 UNL 1 -8.848 0.631 2.920 1.00 0.00 O HETATM 35 C23 UNL 1 -5.572 -3.474 -0.011 1.00 0.00 C HETATM 36 O13 UNL 1 -6.027 -4.560 0.731 1.00 0.00 O HETATM 37 C24 UNL 1 -4.375 -3.936 -0.822 1.00 0.00 C HETATM 38 O14 UNL 1 -4.272 -5.319 -0.742 1.00 0.00 O HETATM 39 C25 UNL 1 -3.064 -3.345 -0.293 1.00 0.00 C HETATM 40 O15 UNL 1 -2.051 -3.816 -1.155 1.00 0.00 O HETATM 41 C26 UNL 1 -1.053 -0.121 -1.423 1.00 0.00 C HETATM 42 C27 UNL 1 -0.578 1.264 -1.894 1.00 0.00 C HETATM 43 C28 UNL 1 0.916 1.143 -1.786 1.00 0.00 C HETATM 44 C29 UNL 1 1.191 -0.227 -2.347 1.00 0.00 C HETATM 45 C30 UNL 1 1.057 -0.100 -3.849 1.00 0.00 C HETATM 46 C31 UNL 1 0.046 -1.037 -1.789 1.00 0.00 C HETATM 47 C32 UNL 1 0.476 -1.915 -0.661 1.00 0.00 C HETATM 48 O16 UNL 1 0.935 -3.168 -1.173 1.00 0.00 O HETATM 49 C33 UNL 1 1.657 -1.411 0.139 1.00 0.00 C HETATM 50 C34 UNL 1 2.817 -1.484 -0.839 1.00 0.00 C HETATM 51 C35 UNL 1 4.093 -1.312 -0.109 1.00 0.00 C HETATM 52 C36 UNL 1 4.499 -2.716 0.405 1.00 0.00 C HETATM 53 C37 UNL 1 3.941 -0.505 1.177 1.00 0.00 C HETATM 54 C38 UNL 1 5.175 -0.504 2.008 1.00 0.00 C HETATM 55 C39 UNL 1 6.467 -0.709 1.263 1.00 0.00 C HETATM 56 O17 UNL 1 7.407 0.049 2.008 1.00 0.00 O HETATM 57 C40 UNL 1 8.459 -0.651 2.486 1.00 0.00 C HETATM 58 O18 UNL 1 8.421 -0.824 3.903 1.00 0.00 O HETATM 59 C41 UNL 1 9.274 -1.906 4.220 1.00 0.00 C HETATM 60 C42 UNL 1 8.918 -2.412 5.585 1.00 0.00 C HETATM 61 O19 UNL 1 7.576 -2.843 5.535 1.00 0.00 O HETATM 62 C43 UNL 1 10.687 -1.405 4.086 1.00 0.00 C HETATM 63 O20 UNL 1 11.166 -1.220 5.408 1.00 0.00 O HETATM 64 C44 UNL 1 10.662 -0.046 3.441 1.00 0.00 C HETATM 65 O21 UNL 1 10.125 0.914 4.331 1.00 0.00 O HETATM 66 C45 UNL 1 9.768 -0.014 2.180 1.00 0.00 C HETATM 67 O22 UNL 1 9.690 1.356 1.876 1.00 0.00 O HETATM 68 C46 UNL 1 10.352 1.719 0.734 1.00 0.00 C HETATM 69 O23 UNL 1 9.479 2.321 -0.166 1.00 0.00 O HETATM 70 C47 UNL 1 10.016 2.444 -1.427 1.00 0.00 C HETATM 71 C48 UNL 1 9.590 3.725 -2.127 1.00 0.00 C HETATM 72 O24 UNL 1 8.216 3.795 -2.272 1.00 0.00 O HETATM 73 C49 UNL 1 11.494 2.250 -1.473 1.00 0.00 C HETATM 74 O25 UNL 1 11.956 2.877 -2.650 1.00 0.00 O HETATM 75 C50 UNL 1 12.257 2.817 -0.324 1.00 0.00 C HETATM 76 O26 UNL 1 12.720 4.106 -0.589 1.00 0.00 O HETATM 77 C51 UNL 1 11.464 2.732 0.959 1.00 0.00 C HETATM 78 O27 UNL 1 10.884 3.990 1.199 1.00 0.00 O HETATM 79 C52 UNL 1 6.395 -0.237 -0.167 1.00 0.00 C HETATM 80 C53 UNL 1 7.691 -0.627 -0.898 1.00 0.00 C HETATM 81 C54 UNL 1 6.380 1.276 -0.120 1.00 0.00 C HETATM 82 C55 UNL 1 5.215 -0.808 -0.940 1.00 0.00 C HETATM 83 C56 UNL 1 4.907 0.148 -2.024 1.00 0.00 C HETATM 84 C57 UNL 1 3.458 0.552 -2.122 1.00 0.00 C HETATM 85 C58 UNL 1 2.570 -0.708 -2.073 1.00 0.00 C HETATM 86 C59 UNL 1 3.035 -1.532 -3.270 1.00 0.00 C HETATM 87 H1 UNL 1 -7.922 -1.485 -3.954 1.00 0.00 H HETATM 88 H2 UNL 1 -7.586 -1.543 -2.130 1.00 0.00 H HETATM 89 H3 UNL 1 -6.652 -2.523 -3.279 1.00 0.00 H HETATM 90 H4 UNL 1 -4.974 0.643 -4.789 1.00 0.00 H HETATM 91 H5 UNL 1 -6.806 0.628 -4.986 1.00 0.00 H HETATM 92 H6 UNL 1 -5.859 -0.823 -5.322 1.00 0.00 H HETATM 93 H7 UNL 1 -5.925 -0.482 -1.259 1.00 0.00 H HETATM 94 H8 UNL 1 -4.487 1.553 -3.099 1.00 0.00 H HETATM 95 H9 UNL 1 -5.050 1.875 -1.479 1.00 0.00 H HETATM 96 H10 UNL 1 -3.209 0.861 -0.373 1.00 0.00 H HETATM 97 H11 UNL 1 -2.636 1.722 -1.805 1.00 0.00 H HETATM 98 H12 UNL 1 -1.618 -0.730 -4.039 1.00 0.00 H HETATM 99 H13 UNL 1 -2.504 0.790 -3.878 1.00 0.00 H HETATM 100 H14 UNL 1 -3.333 -0.826 -3.926 1.00 0.00 H HETATM 101 H15 UNL 1 -2.377 -1.410 0.369 1.00 0.00 H HETATM 102 H16 UNL 1 -4.445 -3.014 1.702 1.00 0.00 H HETATM 103 H17 UNL 1 -5.723 -1.638 2.860 1.00 0.00 H HETATM 104 H18 UNL 1 -6.758 -2.892 2.209 1.00 0.00 H HETATM 105 H19 UNL 1 -8.337 -0.681 -0.064 1.00 0.00 H HETATM 106 H20 UNL 1 -8.317 2.386 1.531 1.00 0.00 H HETATM 107 H21 UNL 1 -7.337 2.827 -1.298 1.00 0.00 H HETATM 108 H22 UNL 1 -6.681 3.483 0.289 1.00 0.00 H HETATM 109 H23 UNL 1 -8.239 4.935 0.316 1.00 0.00 H HETATM 110 H24 UNL 1 -9.436 1.148 -1.053 1.00 0.00 H HETATM 111 H25 UNL 1 -10.473 2.969 -1.168 1.00 0.00 H HETATM 112 H26 UNL 1 -10.752 -0.062 0.316 1.00 0.00 H HETATM 113 H27 UNL 1 -12.363 0.232 0.662 1.00 0.00 H HETATM 114 H28 UNL 1 -13.900 0.698 4.341 1.00 0.00 H HETATM 115 H29 UNL 1 -13.173 2.171 3.613 1.00 0.00 H HETATM 116 H30 UNL 1 -15.674 2.061 3.261 1.00 0.00 H HETATM 117 H31 UNL 1 -16.199 0.216 1.691 1.00 0.00 H HETATM 118 H32 UNL 1 -15.113 3.056 1.322 1.00 0.00 H HETATM 119 H33 UNL 1 -14.754 1.248 -0.450 1.00 0.00 H HETATM 120 H34 UNL 1 -13.153 2.362 -0.067 1.00 0.00 H HETATM 121 H35 UNL 1 -11.841 3.234 1.938 1.00 0.00 H HETATM 122 H36 UNL 1 -9.498 -1.069 1.989 1.00 0.00 H HETATM 123 H37 UNL 1 -9.349 0.214 3.663 1.00 0.00 H HETATM 124 H38 UNL 1 -6.418 -3.146 -0.643 1.00 0.00 H HETATM 125 H39 UNL 1 -6.473 -5.238 0.165 1.00 0.00 H HETATM 126 H40 UNL 1 -4.559 -3.658 -1.868 1.00 0.00 H HETATM 127 H41 UNL 1 -4.422 -5.770 -1.594 1.00 0.00 H HETATM 128 H42 UNL 1 -2.900 -3.730 0.723 1.00 0.00 H HETATM 129 H43 UNL 1 -1.613 -4.574 -0.697 1.00 0.00 H HETATM 130 H44 UNL 1 -1.167 -0.027 -0.344 1.00 0.00 H HETATM 131 H45 UNL 1 -0.829 2.051 -1.112 1.00 0.00 H HETATM 132 H46 UNL 1 -0.946 1.544 -2.871 1.00 0.00 H HETATM 133 H47 UNL 1 1.279 1.350 -0.793 1.00 0.00 H HETATM 134 H48 UNL 1 1.372 1.878 -2.492 1.00 0.00 H HETATM 135 H49 UNL 1 0.298 0.653 -4.169 1.00 0.00 H HETATM 136 H50 UNL 1 1.987 0.225 -4.358 1.00 0.00 H HETATM 137 H51 UNL 1 0.690 -1.076 -4.283 1.00 0.00 H HETATM 138 H52 UNL 1 -0.232 -1.744 -2.633 1.00 0.00 H HETATM 139 H53 UNL 1 -0.280 -2.193 0.073 1.00 0.00 H HETATM 140 H54 UNL 1 0.582 -3.248 -2.089 1.00 0.00 H HETATM 141 H55 UNL 1 1.848 -2.231 0.894 1.00 0.00 H HETATM 142 H56 UNL 1 1.531 -0.499 0.676 1.00 0.00 H HETATM 143 H57 UNL 1 2.757 -2.578 -1.150 1.00 0.00 H HETATM 144 H58 UNL 1 5.422 -3.061 -0.102 1.00 0.00 H HETATM 145 H59 UNL 1 3.726 -3.477 0.138 1.00 0.00 H HETATM 146 H60 UNL 1 4.621 -2.764 1.483 1.00 0.00 H HETATM 147 H61 UNL 1 3.592 0.513 1.023 1.00 0.00 H HETATM 148 H62 UNL 1 3.146 -0.992 1.814 1.00 0.00 H HETATM 149 H63 UNL 1 5.267 0.424 2.628 1.00 0.00 H HETATM 150 H64 UNL 1 5.148 -1.323 2.791 1.00 0.00 H HETATM 151 H65 UNL 1 6.872 -1.748 1.327 1.00 0.00 H HETATM 152 H66 UNL 1 8.414 -1.687 2.035 1.00 0.00 H HETATM 153 H67 UNL 1 9.074 -2.756 3.520 1.00 0.00 H HETATM 154 H68 UNL 1 8.947 -1.593 6.311 1.00 0.00 H HETATM 155 H69 UNL 1 9.507 -3.297 5.886 1.00 0.00 H HETATM 156 H70 UNL 1 7.363 -3.170 4.615 1.00 0.00 H HETATM 157 H71 UNL 1 11.339 -2.117 3.540 1.00 0.00 H HETATM 158 H72 UNL 1 10.864 -0.301 5.708 1.00 0.00 H HETATM 159 H73 UNL 1 11.665 0.309 3.160 1.00 0.00 H HETATM 160 H74 UNL 1 9.963 1.754 3.833 1.00 0.00 H HETATM 161 H75 UNL 1 10.355 -0.473 1.363 1.00 0.00 H HETATM 162 H76 UNL 1 10.799 0.810 0.279 1.00 0.00 H HETATM 163 H77 UNL 1 9.552 1.619 -2.050 1.00 0.00 H HETATM 164 H78 UNL 1 10.018 3.709 -3.171 1.00 0.00 H HETATM 165 H79 UNL 1 10.005 4.632 -1.648 1.00 0.00 H HETATM 166 H80 UNL 1 7.733 4.051 -1.443 1.00 0.00 H HETATM 167 H81 UNL 1 11.715 1.158 -1.624 1.00 0.00 H HETATM 168 H82 UNL 1 12.903 3.135 -2.590 1.00 0.00 H HETATM 169 H83 UNL 1 13.190 2.187 -0.222 1.00 0.00 H HETATM 170 H84 UNL 1 12.977 4.596 0.228 1.00 0.00 H HETATM 171 H85 UNL 1 12.089 2.514 1.824 1.00 0.00 H HETATM 172 H86 UNL 1 11.484 4.541 1.755 1.00 0.00 H HETATM 173 H87 UNL 1 8.595 -0.246 -0.407 1.00 0.00 H HETATM 174 H88 UNL 1 7.688 -0.189 -1.927 1.00 0.00 H HETATM 175 H89 UNL 1 7.798 -1.736 -0.933 1.00 0.00 H HETATM 176 H90 UNL 1 6.979 1.735 -0.930 1.00 0.00 H HETATM 177 H91 UNL 1 6.907 1.598 0.825 1.00 0.00 H HETATM 178 H92 UNL 1 5.367 1.706 -0.037 1.00 0.00 H HETATM 179 H93 UNL 1 5.653 -1.736 -1.436 1.00 0.00 H HETATM 180 H94 UNL 1 5.454 1.113 -1.994 1.00 0.00 H HETATM 181 H95 UNL 1 5.206 -0.287 -3.026 1.00 0.00 H HETATM 182 H96 UNL 1 3.312 1.044 -3.099 1.00 0.00 H HETATM 183 H97 UNL 1 3.210 1.279 -1.347 1.00 0.00 H HETATM 184 H98 UNL 1 3.801 -2.285 -2.895 1.00 0.00 H HETATM 185 H99 UNL 1 3.575 -0.954 -4.020 1.00 0.00 H HETATM 186 HA0 UNL 1 2.235 -2.196 -3.663 1.00 0.00 H CONECT 1 2 87 88 89 CONECT 2 3 4 4 CONECT 3 90 91 92 CONECT 4 5 93 CONECT 5 6 94 95 CONECT 6 7 96 97 CONECT 7 8 9 41 CONECT 8 98 99 100 CONECT 9 10 CONECT 10 11 39 101 CONECT 11 12 CONECT 12 13 35 102 CONECT 13 14 103 104 CONECT 14 15 CONECT 15 16 33 105 CONECT 16 17 CONECT 17 18 20 106 CONECT 18 19 107 108 CONECT 19 109 CONECT 20 21 22 110 CONECT 21 111 CONECT 22 23 33 112 CONECT 23 24 CONECT 24 25 31 113 CONECT 25 26 CONECT 26 27 114 115 CONECT 27 28 29 116 CONECT 28 117 CONECT 29 30 31 118 CONECT 30 119 CONECT 31 32 120 CONECT 32 121 CONECT 33 34 122 CONECT 34 123 CONECT 35 36 37 124 CONECT 36 125 CONECT 37 38 39 126 CONECT 38 127 CONECT 39 40 128 CONECT 40 129 CONECT 41 42 46 130 CONECT 42 43 131 132 CONECT 43 44 133 134 CONECT 44 45 46 85 CONECT 45 135 136 137 CONECT 46 47 138 CONECT 47 48 49 139 CONECT 48 140 CONECT 49 50 141 142 CONECT 50 51 85 143 CONECT 51 52 53 82 CONECT 52 144 145 146 CONECT 53 54 147 148 CONECT 54 55 149 150 CONECT 55 56 79 151 CONECT 56 57 CONECT 57 58 66 152 CONECT 58 59 CONECT 59 60 62 153 CONECT 60 61 154 155 CONECT 61 156 CONECT 62 63 64 157 CONECT 63 158 CONECT 64 65 66 159 CONECT 65 160 CONECT 66 67 161 CONECT 67 68 CONECT 68 69 77 162 CONECT 69 70 CONECT 70 71 73 163 CONECT 71 72 164 165 CONECT 72 166 CONECT 73 74 75 167 CONECT 74 168 CONECT 75 76 77 169 CONECT 76 170 CONECT 77 78 171 CONECT 78 172 CONECT 79 80 81 82 CONECT 80 173 174 175 CONECT 81 176 177 178 CONECT 82 83 179 CONECT 83 84 180 181 CONECT 84 85 182 183 CONECT 85 86 CONECT 86 184 185 186 END SMILES for HMDB0039551 (Ginsenoside Ra3)CC(C)=CCCC(C)(OC1OC(COC2OC(CO)C(O)C(OC3OCC(O)C(O)C3O)C2O)C(O)C(O)C1O)C1CCC2(C)C1C(O)CC1C3(C)CCC(OC4OC(CO)C(O)C(O)C4OC4OC(CO)C(O)C(O)C4O)C(C)(C)C3CCC21C INCHI for HMDB0039551 (Ginsenoside Ra3)InChI=1S/C59H100O27/c1-24(2)10-9-14-59(8,86-53-46(75)42(71)39(68)31(82-53)23-78-51-47(76)48(40(69)30(21-62)79-51)84-50-44(73)36(65)27(64)22-77-50)25-11-16-58(7)35(25)26(63)18-33-56(5)15-13-34(55(3,4)32(56)12-17-57(33,58)6)83-54-49(43(72)38(67)29(20-61)81-54)85-52-45(74)41(70)37(66)28(19-60)80-52/h10,25-54,60-76H,9,11-23H2,1-8H3 3D Structure for HMDB0039551 (Ginsenoside Ra3) | 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| Synonyms |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Formula | C59H100O27 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Molecular Weight | 1241.4091 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Molecular Weight | 1240.645197994 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | 2-{[2-(5-{[4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-{[3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}oxan-2-yl]oxy}-16-hydroxy-2,6,6,10,11-pentamethyltetracyclo[8.7.0.0²,⁷.0¹¹,¹⁵]heptadecan-14-yl)-6-methylhept-5-en-2-yl]oxy}-6-({[3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-4-[(3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl)oxy]oxan-2-yl]oxy}methyl)oxane-3,4,5-triol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | 2-{[2-(5-{[4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-{[3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}oxan-2-yl]oxy}-16-hydroxy-2,6,6,10,11-pentamethyltetracyclo[8.7.0.0²,⁷.0¹¹,¹⁵]heptadecan-14-yl)-6-methylhept-5-en-2-yl]oxy}-6-({[3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-4-[(3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl)oxy]oxan-2-yl]oxy}methyl)oxane-3,4,5-triol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | 90985-77-6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | CC(C)=CCCC(C)(OC1OC(COC2OC(CO)C(O)C(OC3OCC(O)C(O)C3O)C2O)C(O)C(O)C1O)C1CCC2(C)C1C(O)CC1C3(C)CCC(OC4OC(CO)C(O)C(O)C4OC4OC(CO)C(O)C(O)C4O)C(C)(C)C3CCC21C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C59H100O27/c1-24(2)10-9-14-59(8,86-53-46(75)42(71)39(68)31(82-53)23-78-51-47(76)48(40(69)30(21-62)79-51)84-50-44(73)36(65)27(64)22-77-50)25-11-16-58(7)35(25)26(63)18-33-56(5)15-13-34(55(3,4)32(56)12-17-57(33,58)6)83-54-49(43(72)38(67)29(20-61)81-54)85-52-45(74)41(70)37(66)28(19-60)80-52/h10,25-54,60-76H,9,11-23H2,1-8H3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | QUNSGRLNZDSQJC-UHFFFAOYSA-N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as 2,4,5-trisubstituted oxazoles. 2,4,5-Trisubstituted oxazoles are compounds containing an oxazole ring substituted at positions 2, 4 and 5 only. Oxazole is a five-membered aromatic heterocycle with one oxygen, one nitrogen, and three carbon atoms. Isomers include 1,2-oxazole and 1,3-oxazole. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Organoheterocyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Azoles | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Oxazoles | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | 2,4,5-trisubstituted oxazoles | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Substituents |
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| Molecular Framework | Aromatic heteromonocyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physiological effect | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disposition | Biological location
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| Process | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Role | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State | Solid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Molecular Properties |
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| Experimental Chromatographic Properties | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Molecular Properties |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Chromatographic Properties | Predicted Collision Cross Sections
Predicted Kovats Retention IndicesNot Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MS/MS Spectra
NMR Spectra
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations |
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| Biospecimen Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathways |
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| Normal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Abnormal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Associated Disorders and Diseases | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disease References | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Associated OMIM IDs | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | FDB018974 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | C00032756 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 85166230 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ChEBI ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| VMH ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MarkerDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Good Scents ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References |
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