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Showing metabocard for Methacrylyl-CoA (HMDB0001011)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 4.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Expected but not Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2005-11-16 15:48:42 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2020-04-27 15:32:10 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0001011 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
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Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | Methacrylyl-CoA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Methacrylyl-CoA, also known as methacryloyl-CoA, belongs to the class of organic compounds known as organic pyrophosphates. These are organic compounds containing the pyrophosphate oxoanion, with the structure OP([O-])(=O)OP(O)([O-])=O. Thus, methacrylyl-CoA is considered to be a fatty ester lipid molecule. Methacrylyl-CoA is a very hydrophobic molecule, practically insoluble (in water), and relatively neutral. Methacrylyl-CoA has been detected, but not quantified in, several different foods, such as beechnuts, hyacinth beans, devilfish, eggplants, and cupuaçus. This could make methacrylyl-CoA a potential biomarker for the consumption of these foods. Methacrylyl-CoA is a metabolite in the valine, leucine, and isoleucine degradation pathway and highly reacts with free thiol compounds (PMID: 14684172 ). Cirrhosis results in a significant decrease in 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase activity, a key enzyme in the valine catabolic pathway that plays an important role in the catabolism of a potentially toxic compound, methacrylyl-CoA, formed as an intermediate in the catabolism of valine and isobutyrate (PMID: 8938168 ). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C25H40N7O17P3S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 835.608 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 835.141423115 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | {[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-2-({[hydroxy({hydroxy[(3R)-3-hydroxy-2,2-dimethyl-3-{[2-({2-[(2-methylprop-2-enoyl)sulfanyl]ethyl}carbamoyl)ethyl]carbamoyl}propoxy]phosphoryl}oxy)phosphoryl]oxy}methyl)oxolan-3-yl]oxy}phosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | methacrylyl-coa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | 6008-91-9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | CC(=C)C(=O)SCCNC(=O)CCNC(=O)[C@H](O)C(C)(C)COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1OP(O)(O)=O)N1C=NC2=C1N=CN=C2N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C25H40N7O17P3S/c1-13(2)24(37)53-8-7-27-15(33)5-6-28-22(36)19(35)25(3,4)10-46-52(43,44)49-51(41,42)45-9-14-18(48-50(38,39)40)17(34)23(47-14)32-12-31-16-20(26)29-11-30-21(16)32/h11-12,14,17-19,23,34-35H,1,5-10H2,2-4H3,(H,27,33)(H,28,36)(H,41,42)(H,43,44)(H2,26,29,30)(H2,38,39,40)/t14-,17-,18-,19+,23-/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | NPALUEYCDZWBOV-NDZSKPAWSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | belongs to the class of organic compounds known as organic pyrophosphates. These are organic compounds containing the pyrophosphate oxoanion, with the structure OP([O-])(=O)OP(O)([O-])=O. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organic oxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Organic oxoanionic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Organic pyrophosphates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Organic pyrophosphates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disposition | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Process | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Role | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties |
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Predicted Properties |
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Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations |
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Biospecimen Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Normal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Abnormal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated Disorders and Diseases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease References | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | DB01675 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | FDB030999 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | 144985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | C03460 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | METHACRYLYL-COA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Methacrylyl-CoA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 165390 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | 27754 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMH ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MarkerDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Hawes, John W.; Harper, Edwin T. Synthesis of methacrylyl-CoA and (R)- and (S)-3-hydroxyisobutyryl-CoA. Methods in Enzymology (2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References |
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Enzymes
- General function:
- Involved in catalytic activity
- Specific function:
- Straight-chain enoyl-CoA thioesters from C4 up to at least C16 are processed, although with decreasing catalytic rate.
- Gene Name:
- ECHS1
- Uniprot ID:
- P30084
- Molecular weight:
- 31387.085
Reactions
Methacrylyl-CoA + Water → (S)-3-Hydroxyisobutyryl-CoA | details |
- General function:
- Involved in acyl-CoA dehydrogenase activity
- Specific function:
- Has greatest activity toward short branched chain acyl-CoA derivative such as (s)-2-methylbutyryl-CoA, isobutyryl-CoA, and 2-methylhexanoyl-CoA as well as toward short straight chain acyl-CoAs such as butyryl-CoA and hexanoyl-CoA. Can use valproyl-CoA as substrate and may play a role in controlling the metabolic flux of valproic acid in the development of toxicity of this agent.
- Gene Name:
- ACADSB
- Uniprot ID:
- P45954
- Molecular weight:
- 47485.035
Reactions
Isobutyryl-CoA + Acceptor → Methacrylyl-CoA + Reduced acceptor | details |
- General function:
- Involved in acyl-CoA dehydrogenase activity
- Specific function:
- Has very high activity toward isobutyryl-CoA. Is an isobutyryl-CoA dehydrogenase that functions in valine catabolism. Plays a role in transcriptional coactivation within the ARC complex.
- Gene Name:
- ACAD8
- Uniprot ID:
- Q9UKU7
- Molecular weight:
- 45069.39
Reactions
Isobutyryl-CoA + Acceptor → Methacrylyl-CoA + Reduced acceptor | details |