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Showing metabocard for 3a,7a-Dihydroxy-5b-cholestanoyl-CoA (HMDB0002159)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 4.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Expected but not Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2006-05-22 14:17:39 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2020-02-26 21:23:52 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0002159 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
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Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | 3a,7a-Dihydroxy-5b-cholestanoyl-CoA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | PC(22:4(7Z,10Z,13Z,16Z)/18:1(11Z)) is a phosphatidylchloline (PC). It is a glycerophospholipid in which a phosphorylcholine moiety occupies a glycerol substitution site. As is the case with diacylglycerols, phosphatidylcholines can have many different combinations of fatty acids of varying lengths and saturation attached to the C-1 and C-2 positions. PC(22:4(7Z,10Z,13Z,16Z)/18:1(11Z)), in particular, consists of one 7Z,10Z,13Z,16Z-docosatetraenoyl chain to the C-1 atom, and one 11Z-octadecenoyl to the C-2 atom. In E. coli, PCs can be found in the integral component of the cell outer membrane. They are hydrolyzed by Phospholipases to a 2-acylglycerophosphocholine and a carboxylate. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C48H80N7O19P3S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 1184.171 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 1183.444253639 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | {[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-[({[({3-[(2-{[2-({6-[(2S,5R,7S,9R,15R)-5,9-dihydroxy-2,15-dimethyltetracyclo[8.7.0.0²,⁷.0¹¹,¹⁵]heptadecan-14-yl]-2-methylheptanoyl}sulfanyl)ethyl]carbamoyl}ethyl)carbamoyl]-3-hydroxy-2,2-dimethylpropoxy}(hydroxy)phosphoryl)oxy](hydroxy)phosphoryl}oxy)methyl]-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxy}phosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-2-{[({3-[(2-{[2-({6-[(2S,5R,7S,9R,15R)-5,9-dihydroxy-2,15-dimethyltetracyclo[8.7.0.0²,⁷.0¹¹,¹⁵]heptadecan-14-yl]-2-methylheptanoyl}sulfanyl)ethyl]carbamoyl}ethyl)carbamoyl]-3-hydroxy-2,2-dimethylpropoxy(hydroxy)phosphoryl}oxy(hydroxy)phosphoryl)oxy]methyl}-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxyphosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | 2461-62-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | [H][C@@]12C[C@H](O)CC[C@]1(C)C1CC[C@]3(C)C(CCC3C1[C@H](O)C2)C(C)CCCC(C)C(=O)SCCNC(=O)CCNC(=O)C(O)C(C)(C)COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1OP(O)(O)=O)N1C=NC2=C(N)N=CN=C12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C48H80N7O19P3S/c1-26(30-10-11-31-36-32(13-16-48(30,31)6)47(5)15-12-29(56)20-28(47)21-33(36)57)8-7-9-27(2)45(62)78-19-18-50-35(58)14-17-51-43(61)40(60)46(3,4)23-71-77(68,69)74-76(66,67)70-22-34-39(73-75(63,64)65)38(59)44(72-34)55-25-54-37-41(49)52-24-53-42(37)55/h24-34,36,38-40,44,56-57,59-60H,7-23H2,1-6H3,(H,50,58)(H,51,61)(H,66,67)(H,68,69)(H2,49,52,53)(H2,63,64,65)/t26?,27?,28-,29+,30?,31?,32?,33+,34+,36?,38+,39+,40?,44+,47-,48+/m0/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | SBYLHTNKEWSLBA-CPRJDYHCSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | belongs to the class of organic compounds known as phosphatidylcholines. These are glycerophosphocholines in which the two free -OH are attached to one fatty acid each through an ester linkage. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Lipids and lipid-like molecules | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Glycerophospholipids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Glycerophosphocholines | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Phosphatidylcholines | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disposition | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Process | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Role | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties |
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Predicted Properties |
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Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations |
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Biospecimen Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Normal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Abnormal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated Disorders and Diseases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease References | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 53479251 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMH ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MarkerDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References |
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Enzymes
- General function:
- Involved in transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups
- Specific function:
- Abolishes BNIP3-mediated apoptosis and mitochondrial damage.
- Gene Name:
- ACAA2
- Uniprot ID:
- P42765
- Molecular weight:
- 41923.82
Reactions
Propionyl-CoA + Chenodeoxycholoyl-CoA → Coenzyme A + 3a,7a-Dihydroxy-5b-cholestanoyl-CoA | details |
- General function:
- Involved in catalytic activity
- Specific function:
- Acyl-CoA synthetase involved in bile acid metabolism. Proposed to catalyze the first step in the conjugation of C24 bile acids (choloneates) to glycine and taurine before excretion into bile canaliculi by activating them to their CoA thioesters. Seems to activate secondary bile acids entering the liver from the enterohepatic circulation. In vitro, also activates 3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholestanate (THCA), the C27 precursor of cholic acid deriving from the de novo synthesis from cholesterol.
- Gene Name:
- SLC27A5
- Uniprot ID:
- Q9Y2P5
- Molecular weight:
- 75384.375
Reactions
Adenosine triphosphate + 17alpha,20alpha-Dihydroxypregn-4-en-3-one + Coenzyme A → Adenosine monophosphate + Pyrophosphate + 3a,7a-Dihydroxy-5b-cholestanoyl-CoA | details |
- General function:
- Involved in acyl-CoA dehydrogenase activity
- Specific function:
- Has very high activity toward isobutyryl-CoA. Is an isobutyryl-CoA dehydrogenase that functions in valine catabolism. Plays a role in transcriptional coactivation within the ARC complex.
- Gene Name:
- ACAD8
- Uniprot ID:
- Q9UKU7
- Molecular weight:
- 45069.39