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Showing metabocard for Glutaryl-CoA (HMDB0001339)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 4.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Detected but not Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2005-11-16 15:48:42 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2020-09-18 19:31:03 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0001339 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
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Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | Glutaryl-CoA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | glutaryl-CoA belongs to the class of organic compounds known as 2,3,4-saturated fatty acyl coas. These are acyl-CoAs carrying a 2,3,4-saturated fatty acyl chain. Thus, glutaryl-CoA is considered to be a fatty ester lipid molecule. glutaryl-CoA is a very hydrophobic molecule, practically insoluble (in water), and relatively neutral. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C26H42N7O19P3S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 881.633 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 881.146902423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | 5-[(2-{3-[(2R)-3-[({[({[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)oxolan-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl)oxy](hydroxy)phosphoryl}oxy)methyl]-2-hydroxy-3-methylbutanamido]propanamido}ethyl)sulfanyl]-5-oxopentanoic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | glutaryl-coa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | 3131-84-8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | CC(C)(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1OP(O)(O)=O)N1C=NC2=C1N=CN=C2N)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)CCCC(O)=O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C26H42N7O19P3S/c1-26(2,21(39)24(40)29-7-6-15(34)28-8-9-56-17(37)5-3-4-16(35)36)11-49-55(46,47)52-54(44,45)48-10-14-20(51-53(41,42)43)19(38)25(50-14)33-13-32-18-22(27)30-12-31-23(18)33/h12-14,19-21,25,38-39H,3-11H2,1-2H3,(H,28,34)(H,29,40)(H,35,36)(H,44,45)(H,46,47)(H2,27,30,31)(H2,41,42,43)/t14-,19-,20-,21+,25-/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | SYKWLIJQEHRDNH-CKRMAKSASA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | belongs to the class of organic compounds known as 2,3,4-saturated fatty acyl coas. These are acyl-CoAs carrying a 2,3,4-saturated fatty acyl chain. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Lipids and lipid-like molecules | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Fatty Acyls | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Fatty acyl thioesters | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | 2,3,4-saturated fatty acyl CoAs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents |
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Substituents |
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Molecular Framework | Aromatic heteropolycyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disposition | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Process | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Role | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties |
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Predicted Properties |
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Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations |
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Biospecimen Locations |
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Tissue Locations |
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Normal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Abnormal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Associated Disorders and Diseases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease References | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | FDB022563 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | 2338999 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | C00527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | GLUTARYL-COA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Glutaryl-CoA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | 6173 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 3081383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | 15524 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMH ID | GLUTCOA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MarkerDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References |
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Enzymes
- General function:
- Involved in oxidoreductase activity
- Specific function:
- Lipoamide dehydrogenase is a component of the glycine cleavage system as well as of the alpha-ketoacid dehydrogenase complexes. Involved in the hyperactivation of spermatazoa during capacitation and in the spermatazoal acrosome reaction.
- Gene Name:
- DLD
- Uniprot ID:
- P09622
- Molecular weight:
- 54176.91
- General function:
- Involved in acyl-CoA dehydrogenase activity
- Specific function:
- Catalyzes the oxidative decarboxylation of glutaryl-CoA to crotonyl-CoA and CO(2) in the degradative pathway of L-lysine, L-hydroxylysine, and L-tryptophan metabolism. It uses electron transfer flavoprotein as its electron acceptor. Isoform Short is inactive.
- Gene Name:
- GCDH
- Uniprot ID:
- Q92947
- Molecular weight:
- 48126.715
Reactions
Glutaryl-CoA + electron-transfer flavoprotein → Crotonoyl-CoA + CO(2) + reduced electron-transfer flavoprotein | details |
Glutaryl-CoA + FAD → FADH + Crotonoyl-CoA + Carbon dioxide | details |
Glutaryl-CoA + Electron-transferring flavoprotein → Crotonoyl-CoA + Reduced electron-transferring flavoprotein + Carbon dioxide | details |
Glutaryl-CoA + Electron-transferring flavoprotein → Glutaconyl-CoA + Reduced electron-transferring flavoprotein | details |
- General function:
- Involved in oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring) activity
- Specific function:
- The 2-oxoglutarate dehydrogenase complex catalyzes the overall conversion of 2-oxoglutarate to succinyl-CoA and CO(2). It contains multiple copies of three enzymatic components: 2-oxoglutarate dehydrogenase (E1), dihydrolipoamide succinyltransferase (E2) and lipoamide dehydrogenase (E3).
- Gene Name:
- OGDH
- Uniprot ID:
- Q02218
- Molecular weight:
- 48179.59
Reactions
Oxoadipic acid + Coenzyme A + NAD → Glutaryl-CoA + Carbon dioxide + NADH + Hydrogen Ion | details |
- General function:
- Involved in acyltransferase activity
- Specific function:
- The 2-oxoglutarate dehydrogenase complex catalyzes the overall conversion of 2-oxoglutarate to succinyl-CoA and CO(2). It contains multiple copies of 3 enzymatic components: 2-oxoglutarate dehydrogenase (E1), dihydrolipoamide succinyltransferase (E2) and lipoamide dehydrogenase (E3).
- Gene Name:
- DLST
- Uniprot ID:
- P36957
- Molecular weight:
- 48754.87
Reactions
Glutaryl-CoA + Enzyme N6-(dihydrolipoyl)lysine → Coenzyme A + [Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase] S-glutaryldihydrolipoyllysine | details |