You are using an unsupported browser. Please upgrade your browser to a newer version to get the best experience on Human Metabolome Database.
Showing metabocard for Hexanoyl-CoA (HMDB0002845)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Version | 4.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Expected but not Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2006-05-22 15:12:14 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2020-07-10 15:29:26 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0002845 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | Hexanoyl-CoA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Hexanoyl-CoA, also known as hexanoyl-coenzyme A or caproyl-CoA, is a medium-chain fatty acyl-CoA having hexanoyl as the acyl group. Hexanoyl-CoA is slightly soluble (in water) and an extremely strong acidic compound (based on its pKa). Within the cell, hexanoyl-CoA is primarily located in the membrane (predicted from logP). It can also be found in the extracellular space. Hexanoyl-CoA exists in all living organisms, ranging from bacteria to humans. In humans, hexanoyl-CoA is involved in the biosynthesis and oxidation of fatty acids as well as in ceramide formation. Hexanoyl-CoA is also involved in few metabolic disorders, such as fatty acid elongation in mitochondria, mitochondrial beta-oxidation of medium chain saturated fatty acids, and mitochondrial beta-oxidation of short chain saturated fatty acids. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Formula | C27H46N7O17P3S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 865.677 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 865.188373307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | {[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-({[({[(3R)-3-[(2-{[2-(hexanoylsulfanyl)ethyl]carbamoyl}ethyl)carbamoyl]-3-hydroxy-2,2-dimethylpropoxy](hydroxy)phosphoryl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}methyl)-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxy}phosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | hexanoyl-coa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | 5060-32-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | CCCCCC(=O)SCCNC(=O)CCNC(=O)[C@H](O)C(C)(C)COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1OP(O)(O)=O)N1C=NC2=C1N=CN=C2N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C27H46N7O17P3S/c1-4-5-6-7-18(36)55-11-10-29-17(35)8-9-30-25(39)22(38)27(2,3)13-48-54(45,46)51-53(43,44)47-12-16-21(50-52(40,41)42)20(37)26(49-16)34-15-33-19-23(28)31-14-32-24(19)34/h14-16,20-22,26,37-38H,4-13H2,1-3H3,(H,29,35)(H,30,39)(H,43,44)(H,45,46)(H2,28,31,32)(H2,40,41,42)/t16-,20-,21-,22+,26-/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | OEXFMSFODMQEPE-HDRQGHTBSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | belongs to the class of organic compounds known as 2,3,4-saturated fatty acyl coas. These are acyl-CoAs carrying a 2,3,4-saturated fatty acyl chain. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Lipids and lipid-like molecules | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Fatty Acyls | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Fatty acyl thioesters | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | 2,3,4-saturated fatty acyl CoAs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Framework | Aromatic heteropolycyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disposition | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Process | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Role | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biospecimen Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Normal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Abnormal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated Disorders and Diseases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease References | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | DB02563 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | FDB023074 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | 395736 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | C05270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | HEXANOYL-COA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | 459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 449118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | 27540 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMH ID | HXCOA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MarkerDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Pullman, Maynard E. Convenient and versatile method for the purification of CoA thiol esters. Analytical Biochemistry (1973), 54(1), 188-98. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References |
|
Only showing the first 10 proteins. There are 112 proteins in total.
Enzymes
- General function:
- Involved in transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups
- Specific function:
- Abolishes BNIP3-mediated apoptosis and mitochondrial damage.
- Gene Name:
- ACAA2
- Uniprot ID:
- P42765
- Molecular weight:
- 41923.82
Reactions
Hexanoyl-CoA + Acetyl-CoA → Coenzyme A + 3-Oxooctanoyl-CoA | details |
- General function:
- Involved in oxidoreductase activity
- Specific function:
- Plays a role in valine and pyrimidine metabolism. Binds fatty acyl-CoA.
- Gene Name:
- ALDH6A1
- Uniprot ID:
- Q02252
- Molecular weight:
- 57839.31
- General function:
- Involved in acyl-CoA dehydrogenase activity
- Specific function:
- Catalyzes the desaturation of acyl-CoAs to 2-trans-enoyl-CoAs. Isoform 1 shows highest activity against medium-chain fatty acyl-CoAs and activity decreases with increasing chain length. Isoform 2 is active against a much broader range of substrates and shows activity towards very long-chain acyl-CoAs. Isoform 2 is twice as active as isoform 1 against 16-hydroxy-palmitoyl-CoA and is 25% more active against 1,16-hexadecanodioyl-CoA.
- Gene Name:
- ACOX1
- Uniprot ID:
- Q15067
- Molecular weight:
- 70135.205
Reactions
Hexanoyl-CoA + FAD → trans-2-Hexenoyl-CoA + FADH | details |
- General function:
- Involved in acyl-CoA dehydrogenase activity
- Specific function:
- Oxidizes the CoA esters of the bile acid intermediates di- and tri-hydroxycholestanoic acids.
- Gene Name:
- ACOX2
- Uniprot ID:
- Q99424
- Molecular weight:
- 76826.14
- General function:
- Involved in acyl-CoA dehydrogenase activity
- Specific function:
- Not Available
- Gene Name:
- IVD
- Uniprot ID:
- P26440
- Molecular weight:
- 43055.325
Transporters
- General function:
- Lipid transport and metabolism
- Specific function:
- Involved in translocation of long-chain fatty acids (LFCA) across the plasma membrane. The LFCA import appears to be hormone-regulated in a tissue-specific manner. In adipocytes, but not myocytes, insulin induces a rapid translocation of FATP1 from intracellular compartments to the plasma membrane, paralleled by increased LFCA uptake. May act directly as a bona fide transporter, or alternatively, in a cytoplasmic or membrane- associated multimeric protein complex to trap and draw fatty acids towards accumulation. Plays a pivotal role in regulating available LFCA substrates from exogenous sources in tissues undergoing high levels of beta-oxidation or triglyceride synthesis. May be involved in regulation of cholesterol metabolism. Has acyl-CoA ligase activity for long-chain and very-long-chain fatty acids
- Gene Name:
- SLC27A1
- Uniprot ID:
- Q6PCB7
- Molecular weight:
- 71107.5
Only showing the first 10 proteins. There are 112 proteins in total.