Showing metabocard for DG(5-iso PGF2VI/0:0/2:0) (HMDB0296946)
Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 5.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Predicted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2021-09-19 05:15:47 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-11-30 20:10:08 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0296946 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | DG(5-iso PGF2VI/0:0/2:0) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | DG(5-iso PGF2VI/0:0/2:0) belongs to the family of Diacylglycerols. These are glycerolipids lipids containing a common glycerol backbone to which at least one fatty acyl group is esterified. It is involved in the phospholipid metabolic pathway. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C23H38O8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 442.549 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 442.256668184 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | (2S)-3-(acetyloxy)-2-hydroxypropyl (3Z)-5-[(1S,2R,3R,5S)-3,5-dihydroxy-2-[(1E,3R)-3-hydroxyoct-1-en-1-yl]cyclopentyl]pent-3-enoate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | (2S)-3-(acetyloxy)-2-hydroxypropyl (3Z)-5-[(1S,2R,3R,5S)-3,5-dihydroxy-2-[(1E,3R)-3-hydroxyoct-1-en-1-yl]cyclopentyl]pent-3-enoate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | CCCCC[C@@H](O)\C=C\[C@H]1[C@H](O)C[C@H](O)[C@H]1C\C=C/CC(=O)OC[C@@H](O)COC(C)=O | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C23H38O8/c1-3-4-5-8-17(25)11-12-20-19(21(27)13-22(20)28)9-6-7-10-23(29)31-15-18(26)14-30-16(2)24/h6-7,11-12,17-22,25-28H,3-5,8-10,13-15H2,1-2H3/b7-6-,12-11+/t17-,18+,19+,20-,21+,22-/m1/s1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | QQDTZFRPFBHOJL-HUSWSDFISA-N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Classification | Not classified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physiological effect | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disposition | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Process | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Role | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Molecular Properties |
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Experimental Chromatographic Properties | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Molecular Properties |
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Predicted Chromatographic Properties | Predicted Collision Cross Sections
Predicted Kovats Retention IndicesNot Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MS/MS Spectra
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Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biospecimen Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways |
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Normal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Abnormal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated Disorders and Diseases | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease References | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMH ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MarkerDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Good Scents ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References | Not Available |
Only showing the first 10 proteins. There are 132 proteins in total.
Enzymes
- General function:
- Involved in diacylglycerol kinase activity
- Specific function:
- Phosphorylates diacylglycerol (DAG) to generate phosphatidic acid (PA). May regulate the activity of protein kinase C by controlling the balance between these two signaling lipids. Activated in the nucleus in response to alpha-thrombin and nerve growth factor. May be involved in cAMP- induced activation of NR5A1 and subsequent steroidogenic gene transcription by delivering PA as ligand for NR5A1. Acts synergistically with NR5A1 on CYP17 transcriptional activity
- Gene Name:
- DGKQ
- Uniprot ID:
- P52824
- Molecular weight:
- 101154.0
- General function:
- Involved in catalytic activity
- Specific function:
- Not Available
- Gene Name:
- PNLIP
- Uniprot ID:
- P16233
- Molecular weight:
- 51156.48
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes.
- Gene Name:
- PLCB1
- Uniprot ID:
- Q9NQ66
- Molecular weight:
- 138565.805
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes. This form has a role in retina signal transduction.
- Gene Name:
- PLCB4
- Uniprot ID:
- Q15147
- Molecular weight:
- 136105.065
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes.
- Gene Name:
- PLCB2
- Uniprot ID:
- Q00722
- Molecular weight:
- 134023.21
- General function:
- Involved in diacylglycerol kinase activity
- Specific function:
- Reverses the normal flow of glycerolipid biosynthesis by phosphorylating diacylglycerol back to phosphatidic acid
- Gene Name:
- DGKG
- Uniprot ID:
- P49619
- Molecular weight:
- 89095.3
- General function:
- Involved in catalytic activity
- Specific function:
- Hepatic lipase has the capacity to catalyze hydrolysis of phospholipids, mono-, di-, and triglycerides, and acyl-CoA thioesters. It is an important enzyme in HDL metabolism. Hepatic lipase binds heparin.
- Gene Name:
- LIPC
- Uniprot ID:
- P11150
- Molecular weight:
- 55914.1
- General function:
- Involved in lipid metabolic process
- Specific function:
- Crucial for the intracellular hydrolysis of cholesteryl esters and triglycerides that have been internalized via receptor-mediated endocytosis of lipoprotein particles. Important in mediating the effect of LDL (low density lipoprotein) uptake on suppression of hydroxymethylglutaryl-CoA reductase and activation of endogenous cellular cholesteryl ester formation.
- Gene Name:
- LIPA
- Uniprot ID:
- P38571
- Molecular weight:
- 45418.71
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes.
- Gene Name:
- PLCB3
- Uniprot ID:
- Q01970
- Molecular weight:
- 138797.725
- General function:
- Involved in catalytic activity
- Specific function:
- May function as inhibitor of dietary triglyceride digestion. Lacks detectable lipase activity towards triglycerides, diglycerides, phosphatidylcholine, galactolipids or cholesterol esters (in vitro) (By similarity).
- Gene Name:
- PNLIPRP1
- Uniprot ID:
- P54315
- Molecular weight:
- Not Available
Transporters
- General function:
- Lipid transport and metabolism
- Specific function:
- Involved in translocation of long-chain fatty acids (LFCA) across the plasma membrane. The LFCA import appears to be hormone-regulated in a tissue-specific manner. In adipocytes, but not myocytes, insulin induces a rapid translocation of FATP1 from intracellular compartments to the plasma membrane, paralleled by increased LFCA uptake. May act directly as a bona fide transporter, or alternatively, in a cytoplasmic or membrane- associated multimeric protein complex to trap and draw fatty acids towards accumulation. Plays a pivotal role in regulating available LFCA substrates from exogenous sources in tissues undergoing high levels of beta-oxidation or triglyceride synthesis. May be involved in regulation of cholesterol metabolism. Has acyl-CoA ligase activity for long-chain and very-long-chain fatty acids
- Gene Name:
- SLC27A1
- Uniprot ID:
- Q6PCB7
- Molecular weight:
- 71107.5
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