Showing metabocard for DG(i-16:0/20:4(5Z,8Z,11Z,13E)-OH(15S)/0:0) (HMDB0299172)
Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Version | 5.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Predicted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2021-09-19 21:33:13 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-11-30 20:11:05 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0299172 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | DG(i-16:0/20:4(5Z,8Z,11Z,13E)-OH(15S)/0:0) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | DG(i-16:0/20:4(5Z,8Z,11Z,13E)-OH(15S)/0:0) belongs to the family of Diacylglycerols. These are glycerolipids lipids containing a common glycerol backbone to which at least one fatty acyl group is esterified. DG(i-16:0/20:4(5Z,8Z,11Z,13E)-OH(15S)/0:0) is also a substrate of diacylglycerol kinase. It is involved in the phospholipid metabolic pathway. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Formula | C39H68O6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 632.967 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 632.50158991 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | (2S)-1-hydroxy-3-[(14-methylpentadecanoyl)oxy]propan-2-yl (5Z,8Z,11Z,13E,15S)-15-hydroxyicosa-5,8,11,13-tetraenoate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | (2S)-1-hydroxy-3-[(14-methylpentadecanoyl)oxy]propan-2-yl (5Z,8Z,11Z,13E,15S)-15-hydroxyicosa-5,8,11,13-tetraenoate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | CCCCC[C@H](O)\C=C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCC(=O)O[C@@H](CO)COC(=O)CCCCCCCCCCCCC(C)C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C39H68O6/c1-4-5-23-29-36(41)30-25-20-16-12-7-6-8-14-18-22-27-32-39(43)45-37(33-40)34-44-38(42)31-26-21-17-13-10-9-11-15-19-24-28-35(2)3/h6-7,14,16,18,20,25,30,35-37,40-41H,4-5,8-13,15,17,19,21-24,26-29,31-34H2,1-3H3/b7-6-,18-14-,20-16-,30-25+/t36-,37-/m0/s1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | SNILAQQENMECGK-GQMOTPDJSA-N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Classification | Not classified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physiological effect | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disposition | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Process | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Role | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Molecular Properties |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Chromatographic Properties | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Molecular Properties |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Chromatographic Properties | Predicted Collision Cross Sections
Predicted Kovats Retention IndicesNot Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biospecimen Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Normal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Abnormal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated Disorders and Diseases | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease References | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMH ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MarkerDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Good Scents ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References | Not Available |
Only showing the first 10 proteins. There are 132 proteins in total.
Enzymes
- General function:
- Involved in diacylglycerol kinase activity
- Specific function:
- Phosphorylates diacylglycerol (DAG) to generate phosphatidic acid (PA). May regulate the activity of protein kinase C by controlling the balance between these two signaling lipids. Activated in the nucleus in response to alpha-thrombin and nerve growth factor. May be involved in cAMP- induced activation of NR5A1 and subsequent steroidogenic gene transcription by delivering PA as ligand for NR5A1. Acts synergistically with NR5A1 on CYP17 transcriptional activity
- Gene Name:
- DGKQ
- Uniprot ID:
- P52824
- Molecular weight:
- 101154.0
- General function:
- Involved in catalytic activity
- Specific function:
- Not Available
- Gene Name:
- PNLIP
- Uniprot ID:
- P16233
- Molecular weight:
- 51156.48
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes.
- Gene Name:
- PLCB1
- Uniprot ID:
- Q9NQ66
- Molecular weight:
- 138565.805
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes. This form has a role in retina signal transduction.
- Gene Name:
- PLCB4
- Uniprot ID:
- Q15147
- Molecular weight:
- 136105.065
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes.
- Gene Name:
- PLCB2
- Uniprot ID:
- Q00722
- Molecular weight:
- 134023.21
- General function:
- Involved in diacylglycerol kinase activity
- Specific function:
- Reverses the normal flow of glycerolipid biosynthesis by phosphorylating diacylglycerol back to phosphatidic acid
- Gene Name:
- DGKG
- Uniprot ID:
- P49619
- Molecular weight:
- 89095.3
- General function:
- Involved in catalytic activity
- Specific function:
- Hepatic lipase has the capacity to catalyze hydrolysis of phospholipids, mono-, di-, and triglycerides, and acyl-CoA thioesters. It is an important enzyme in HDL metabolism. Hepatic lipase binds heparin.
- Gene Name:
- LIPC
- Uniprot ID:
- P11150
- Molecular weight:
- 55914.1
- General function:
- Involved in lipid metabolic process
- Specific function:
- Crucial for the intracellular hydrolysis of cholesteryl esters and triglycerides that have been internalized via receptor-mediated endocytosis of lipoprotein particles. Important in mediating the effect of LDL (low density lipoprotein) uptake on suppression of hydroxymethylglutaryl-CoA reductase and activation of endogenous cellular cholesteryl ester formation.
- Gene Name:
- LIPA
- Uniprot ID:
- P38571
- Molecular weight:
- 45418.71
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes.
- Gene Name:
- PLCB3
- Uniprot ID:
- Q01970
- Molecular weight:
- 138797.725
- General function:
- Involved in catalytic activity
- Specific function:
- May function as inhibitor of dietary triglyceride digestion. Lacks detectable lipase activity towards triglycerides, diglycerides, phosphatidylcholine, galactolipids or cholesterol esters (in vitro) (By similarity).
- Gene Name:
- PNLIPRP1
- Uniprot ID:
- P54315
- Molecular weight:
- Not Available
Transporters
- General function:
- Lipid transport and metabolism
- Specific function:
- Involved in translocation of long-chain fatty acids (LFCA) across the plasma membrane. The LFCA import appears to be hormone-regulated in a tissue-specific manner. In adipocytes, but not myocytes, insulin induces a rapid translocation of FATP1 from intracellular compartments to the plasma membrane, paralleled by increased LFCA uptake. May act directly as a bona fide transporter, or alternatively, in a cytoplasmic or membrane- associated multimeric protein complex to trap and draw fatty acids towards accumulation. Plays a pivotal role in regulating available LFCA substrates from exogenous sources in tissues undergoing high levels of beta-oxidation or triglyceride synthesis. May be involved in regulation of cholesterol metabolism. Has acyl-CoA ligase activity for long-chain and very-long-chain fatty acids
- Gene Name:
- SLC27A1
- Uniprot ID:
- Q6PCB7
- Molecular weight:
- 71107.5
Only showing the first 10 proteins. There are 132 proteins in total.