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Showing metabocard for Propionyl-CoA (HMDB0001275)
| Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Version | 4.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Status | Expected but not Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2005-11-16 15:48:42 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2020-02-26 21:23:09 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | HMDB0001275 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Secondary Accession Numbers |
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| Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | Propionyl-CoA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Propionyl-CoA is an intermediate in the metabolism of propanoate. Propionic aciduria is caused by an autosomal recessive disorder of propionyl coenzyme A (CoA) carboxylase deficiency (EC 6.4.1.3). In propionic aciduria, propionyl CoA accumulates within the mitochondria in massive quantities; free carnitine is then esterified, creating propionyl carnitine, which is then excreted in the urine. Because the supply of carnitine in the diet and from synthesis is limited, such patients readily develop carnitine deficiency as a result of the increased loss of acylcarnitine derivatives. This condition demands supplementation of free carnitine above the normal dietary intake to continue to remove (detoxify) the accumulating organic acids. Propionyl-CoA is a substrate for Acyl-CoA dehydrogenase (medium-chain specific, mitochondrial), Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like (mitochondrial), Propionyl-CoA carboxylase alpha chain (mitochondrial), Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (mitochondrial), Trifunctional enzyme beta subunit (mitochondrial), 3-ketoacyl-CoA thiolase (peroxisomal), Acyl-CoA dehydrogenase (long-chain specific, mitochondrial), Malonyl-CoA decarboxylase (mitochondrial), Acetyl-coenzyme A synthetase (cytoplasmic), 3-ketoacyl-CoA thiolase (mitochondrial) and Propionyl-CoA carboxylase beta chain (mitochondrial). (PMID: 10650319 ). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
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| Chemical Formula | C24H40N7O17P3S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Molecular Weight | 823.597 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Molecular Weight | 823.141423115 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | {[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-2-({[hydroxy({[hydroxy({3-hydroxy-2,2-dimethyl-3-[(2-{[2-(propanoylsulfanyl)ethyl]carbamoyl}ethyl)carbamoyl]propoxy})phosphoryl]oxy})phosphoryl]oxy}methyl)oxolan-3-yl]oxy}phosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-2-[({hydroxy[hydroxy(3-hydroxy-2,2-dimethyl-3-[(2-{[2-(propanoylsulfanyl)ethyl]carbamoyl}ethyl)carbamoyl]propoxy)phosphoryl]oxyphosphoryl}oxy)methyl]oxolan-3-yl]oxyphosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | 317-66-8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | CCC(=O)SCCNC(=O)CCNC(=O)C(O)C(C)(C)COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1OP(O)(O)=O)N1C=NC2=C1N=CN=C2N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C24H40N7O17P3S/c1-4-15(33)52-8-7-26-14(32)5-6-27-22(36)19(35)24(2,3)10-45-51(42,43)48-50(40,41)44-9-13-18(47-49(37,38)39)17(34)23(46-13)31-12-30-16-20(25)28-11-29-21(16)31/h11-13,17-19,23,34-35H,4-10H2,1-3H3,(H,26,32)(H,27,36)(H,40,41)(H,42,43)(H2,25,28,29)(H2,37,38,39)/t13-,17-,18-,19?,23-/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | QAQREVBBADEHPA-UXYNFSPESA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | belongs to the class of organic compounds known as acyl coas. These are organic compounds containing a coenzyme A substructure linked to an acyl chain. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Lipids and lipid-like molecules | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Fatty Acyls | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Fatty acyl thioesters | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Acyl CoAs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Substituents | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Framework | Aromatic heteropolycyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physiological effect | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disposition | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Process |
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| Role | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Properties |
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| Predicted Properties |
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| Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations |
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| Biospecimen Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathways |
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| Normal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Abnormal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Associated Disorders and Diseases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disease References | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Associated OMIM IDs | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FoodDB ID | FDB022529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | 388310 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | C00100 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | 33852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Propionyl-CoA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | 6130 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 439164 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | 15539 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| VMH ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Sokatch, John R.; Sanders, Lois E.; Marshall, Vincent P. Oxidation of methylmalonate semialdehyde to propionyl coenzyme A in Pseudomonas aeruginosa grown on valine. Journal of Biological Chemistry (1968), 243(10), 2500-6. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References |
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Only showing the first 10 proteins. There are 122 proteins in total.
Enzymes
- General function:
- Involved in malonyl-CoA decarboxylase activity
- Specific function:
- Catalyzes the conversion of malonyl-CoA to acetyl-CoA. In the fatty acid biosynthesis MCD selectively removes malonyl-CoA and thus assures that methyl-malonyl-CoA is the only chain elongating substrate for fatty acid synthase and that fatty acids with multiple methyl side chains are produced. In peroxisomes it may be involved in degrading intraperoxisomal malonyl-CoA, which is generated by the peroxisomal beta-oxidation of odd chain-length dicarboxylic fatty acids.
- Gene Name:
- MLYCD
- Uniprot ID:
- O95822
- Molecular weight:
- 55002.94
- General function:
- Involved in acyltransferase activity
- Specific function:
- Carnitine acetylase is specific for short chain fatty acids. Carnitine acetylase seems to affect the flux through the pyruvate dehydrogenase complex. It may be involved as well in the transport of acetyl-CoA into mitochondria.
- Gene Name:
- CRAT
- Uniprot ID:
- P43155
- Molecular weight:
- 70875.095
- General function:
- Involved in transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups
- Specific function:
- Abolishes BNIP3-mediated apoptosis and mitochondrial damage.
- Gene Name:
- ACAA2
- Uniprot ID:
- P42765
- Molecular weight:
- 41923.82
Reactions
| Propionyl-CoA + Acetyl-CoA → Coenzyme A + 2-Methylacetoacetyl-CoA | details |
| Propionyl-CoA + Chenodeoxycholoyl-CoA → Coenzyme A + 3a,7a-Dihydroxy-5b-cholestanoyl-CoA | details |
- General function:
- Involved in acetate-CoA ligase activity
- Specific function:
- Activates acetate so that it can be used for lipid synthesis or for energy generation.
- Gene Name:
- ACSS2
- Uniprot ID:
- Q9NR19
- Molecular weight:
- 78579.11
Reactions
| Propinol adenylate + Coenzyme A → Adenosine monophosphate + Propionyl-CoA | details |
- General function:
- Involved in acetate-CoA ligase activity
- Specific function:
- Important for maintaining normal body temperature during fasting and for energy homeostasis. Essential for energy expenditure under ketogenic conditions (By similarity). Converts acetate to acetyl-CoA so that it can be used for oxidation through the tricarboxylic cycle to produce ATP and CO(2).
- Gene Name:
- ACSS1
- Uniprot ID:
- Q9NUB1
- Molecular weight:
- 74625.88
Reactions
| Propinol adenylate + Coenzyme A → Adenosine monophosphate + Propionyl-CoA | details |
- General function:
- Involved in transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups
- Specific function:
- Not Available
- Gene Name:
- ACAA1
- Uniprot ID:
- P09110
- Molecular weight:
- 34664.46
Reactions
| Propionyl-CoA + Acetyl-CoA → Coenzyme A + 2-Methylacetoacetyl-CoA | details |
| Propionyl-CoA + Chenodeoxycholoyl-CoA → Coenzyme A + 3a,7a-Dihydroxy-5b-cholestanoyl-CoA | details |
- General function:
- Involved in transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups
- Specific function:
- Not Available
- Gene Name:
- HADHB
- Uniprot ID:
- P55084
- Molecular weight:
- 51293.955
Reactions
| Propionyl-CoA + Acetyl-CoA → Coenzyme A + 2-Methylacetoacetyl-CoA | details |
| Propionyl-CoA + Chenodeoxycholoyl-CoA → Coenzyme A + 3a,7a-Dihydroxy-5b-cholestanoyl-CoA | details |
- General function:
- Involved in oxidoreductase activity
- Specific function:
- Plays a role in valine and pyrimidine metabolism. Binds fatty acyl-CoA.
- Gene Name:
- ALDH6A1
- Uniprot ID:
- Q02252
- Molecular weight:
- 57839.31
Reactions
| 2-Methyl-3-oxopropanoic acid + Coenzyme A + Water + NAD → Propionyl-CoA + Hydrogen carbonate + NADH | details |
| (S)-Methylmalonic acid semialdehyde + Coenzyme A + NAD → Propionyl-CoA + Carbon dioxide + NADH + Hydrogen Ion | details |
- General function:
- Involved in acyl-CoA dehydrogenase activity
- Specific function:
- Not Available
- Gene Name:
- ACADL
- Uniprot ID:
- P28330
- Molecular weight:
- 47655.275
- General function:
- Involved in acyl-CoA dehydrogenase activity
- Specific function:
- Not Available
- Gene Name:
- ACADS
- Uniprot ID:
- P16219
- Molecular weight:
- 44296.705
Transporters
- General function:
- Lipid transport and metabolism
- Specific function:
- Involved in translocation of long-chain fatty acids (LFCA) across the plasma membrane. The LFCA import appears to be hormone-regulated in a tissue-specific manner. In adipocytes, but not myocytes, insulin induces a rapid translocation of FATP1 from intracellular compartments to the plasma membrane, paralleled by increased LFCA uptake. May act directly as a bona fide transporter, or alternatively, in a cytoplasmic or membrane- associated multimeric protein complex to trap and draw fatty acids towards accumulation. Plays a pivotal role in regulating available LFCA substrates from exogenous sources in tissues undergoing high levels of beta-oxidation or triglyceride synthesis. May be involved in regulation of cholesterol metabolism. Has acyl-CoA ligase activity for long-chain and very-long-chain fatty acids
- Gene Name:
- SLC27A1
- Uniprot ID:
- Q6PCB7
- Molecular weight:
- 71107.5
Only showing the first 10 proteins. There are 122 proteins in total.