Showing metabocard for PIP(22:2(13Z,16Z)/16:0) (HMDB0010023)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 5.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Expected but not Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2008-09-12 02:03:47 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-11-30 19:03:46 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0010023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
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Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | PIP(22:2(13Z,16Z)/16:0) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | PIP(22:2(13Z,16Z)/16:0) is a phosphatidylinositol phosphate. Phosphatidylinositol phosphates are acidic (anionic) phospholipids that consist of a phosphatidic acid backbone, linked via the phosphate group to a phosphorylated inositol (hexahydroxycyclohexane). Phosphatidylinositol phosphates are generated from phosphatidylinositols, which are phosphorylated by a number of different kinases that place the phosphate moiety on positions 4 and 5 of the inositol ring, although position 3 can also be phosphorylated. Phosphatidylinositols phosphates can have many different combinations of fatty acids of varying lengths and saturation attached at the C-1 and C-2 positions. Fatty acids containing 18 and 20 carbons are the most common. PIP(22:2(13Z,16Z)/16:0), in particular, consists of one chain of docosadienoic acid at the C-1 position and one chain of palmitic acid at the C-2 position. The docosadienoic acid moiety is derived from animal fats, while the palmitic acid moiety is derived from fish oils, milk fats, vegetable oils and animal fats. The most important phosphatidylinositol phosphate in both quantitative and biological terms is phosphatidylinositol 4-phosphate. Phosphatidylinositol and the phosphatidylinositol phosphates are the main source of diacylglycerols that serve as signaling molecules, via the action of phospholipase C enzymes. Phosphatidylinositols phosphates are usually present at low levels only in tissues, typically at about 1 to 3% of the concentration of phosphatidylinositol. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C47H88O16P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 971.1395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 970.554759792 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | {[(1R,3S)-3-({[(2R)-3-[(13Z,16Z)-docosa-13,16-dienoyloxy]-2-(hexadecanoyloxy)propoxy](hydroxy)phosphoryl}oxy)-2,4,5,6-tetrahydroxycyclohexyl]oxy}phosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | [(1R,3S)-3-{[(2R)-3-[(13Z,16Z)-docosa-13,16-dienoyloxy]-2-(hexadecanoyloxy)propoxy(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2,4,5,6-tetrahydroxycyclohexyl]oxyphosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)O[C@]([H])(COC(=O)CCCCCCCCCCC\C=C/C\C=C/CCCCC)COP(O)(=O)O[C@H]1C(O)C(O)C(O)[C@@H](OP(=O)(O)O)C1O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C47H88O16P2/c1-3-5-7-9-11-13-15-17-18-19-20-21-22-24-25-27-29-31-33-35-40(48)59-37-39(61-41(49)36-34-32-30-28-26-23-16-14-12-10-8-6-4-2)38-60-65(57,58)63-47-44(52)42(50)43(51)46(45(47)53)62-64(54,55)56/h11,13,17-18,39,42-47,50-53H,3-10,12,14-16,19-38H2,1-2H3,(H,57,58)(H2,54,55,56)/b13-11-,18-17-/t39-,42?,43?,44?,45?,46-,47+/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | IRUVBUYWSSKKPM-ADDDISLLSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as glycerophosphoinositol phosphates. These are lipids containing a common glycerophosphate skeleton linked to at least one fatty acyl chain and an inositol-5-phosphate moiety. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Lipids and lipid-like molecules | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Glycerophospholipids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Glycerophosphoinositol phosphates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Glycerophosphoinositol phosphates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic homomonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physiological effect | Health effect
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Disposition | Biological location
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Process | Naturally occurring process
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Role | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Molecular Properties |
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Experimental Chromatographic Properties | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Molecular Properties |
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Predicted Chromatographic Properties | Predicted Collision Cross Sections
Predicted Kovats Retention IndicesNot Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MS/MS Spectra
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations |
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Biospecimen Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Locations |
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Pathways |
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Normal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Abnormal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated Disorders and Diseases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease References | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | FDB027209 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | 24767903 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | C00626 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Phosphatidylinositols | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 131750513 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMH ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MarkerDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Good Scents ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References | Not Available |
Only showing the first 10 proteins. There are 80 proteins in total.
Enzymes
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes.
- Gene Name:
- PLCB1
- Uniprot ID:
- Q9NQ66
- Molecular weight:
- 138565.805
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes. This form has a role in retina signal transduction.
- Gene Name:
- PLCB4
- Uniprot ID:
- Q15147
- Molecular weight:
- 136105.065
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes.
- Gene Name:
- PLCB2
- Uniprot ID:
- Q00722
- Molecular weight:
- 134023.21
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes.
- Gene Name:
- PLCB3
- Uniprot ID:
- Q01970
- Molecular weight:
- 138797.725
- General function:
- Involved in phosphoinositide phospholipase C activity
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes. It is a crucial enzyme in transmembrane signaling.
- Gene Name:
- PLCG2
- Uniprot ID:
- P16885
- Molecular weight:
- 147868.67
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- Mediates the production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3). Plays an important role in the regulation of intracellular signaling cascades. Becomes activated in response to ligand-mediated activation of receptor-type tyrosine kinases, such as PDGFRA, PDGFRB, FGFR1, FGFR2, FGFR3 and FGFR4. Plays a role in actin reorganization and cell migration.
- Gene Name:
- PLCG1
- Uniprot ID:
- P19174
- Molecular weight:
- 148658.92
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes. Essential for trophoblast and placental development.
- Gene Name:
- PLCD1
- Uniprot ID:
- P51178
- Molecular weight:
- 88134.23
- General function:
- Involved in N-acetylglucosaminylphosphatidylinositol de
- Specific function:
- Involved in the second step of GPI biosynthesis. De-N-acetylation of N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol.
- Gene Name:
- PIGL
- Uniprot ID:
- Q9Y2B2
- Molecular weight:
- 28530.965
- General function:
- Involved in phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase activity
- Specific function:
- Part of the complex catalyzing the transfer of N-acetylglucosamine from UDP-N-acetylglucosamine to phosphatidylinositol, the first step of GPI biosynthesis.
- Gene Name:
- PIGQ
- Uniprot ID:
- Q9BRB3
- Molecular weight:
- 65343.25
- General function:
- Involved in biosynthetic process
- Specific function:
- Necessary for the synthesis of N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol, the very early intermediate in GPI-anchor biosynthesis.
- Gene Name:
- PIGA
- Uniprot ID:
- P37287
- Molecular weight:
- 54126.065
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