Showing metabocard for PE(DiMe(9,3)/DiMe(9,3)) (HMDB0061501)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 5.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Expected but not Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2014-04-11 22:00:51 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-11-30 19:11:53 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0061501 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
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Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | PE(DiMe(9,3)/DiMe(9,3)) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | PE(DiMe(9,3)/DiMe(9,3)) is a phosphatidylethanolamine (PE or GPEtn). It is a glycerophospholipid in which a phosphorylethanolamine moiety occupies a glycerol substitution site. As is the case with diacylglycerols, glycerophosphoethanolamines can have many different combinations of fatty acids of varying lengths and saturation attached at the C-1 and C-2 positions. Fatty acids containing 16, 18 and 20 carbons are the most common. PE(DiMe(9,3)/DiMe(9,3)), in particular, consists of two chains of 10,13-epoxy-11-methylhexadeca-10,12-dienoic acid at the C-1 and C-2 positions. The 10,13-epoxy-11-methylhexadeca-10,12-dienoic acid moieties are derived from fish oil. Phospholipids, are ubiquitous in nature and are key components of the lipid bilayer of cells, as well as being involved in metabolism and signaling. While most phospholipids have a saturated fatty acid on C-1 and an unsaturated fatty acid on C-2 of the glycerol backbone, the fatty acid distribution at the C-1 and C-2 positions of glycerol within phospholipids is continually in flux, owing to phospholipid degradation and the continuous phospholipid remodeling that occurs while these molecules are in membranes. PEs are neutral zwitterions at physiological pH. They mostly have palmitic or stearic acid on carbon 1 and a long chain unsaturated fatty acid (e.g. 18:2, 20:4 and 22:6) on carbon 2. PE synthesis can occur via two pathways. The first requires that ethanolamine be activated by phosphorylation and then coupled to CDP. The ethanolamine is then transferred from CDP-ethanolamine to phosphatidic acid to yield PE. The second involves the decarboxylation of PS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C41H70NO10P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 767.969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 767.473733977 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | (2-aminoethoxy)[(2R)-2,3-bis({[9-(3,4-dimethyl-5-propylfuran-2-yl)nonanoyl]oxy})propoxy]phosphinic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | 2-aminoethoxy((2R)-2,3-bis({[9-(3,4-dimethyl-5-propylfuran-2-yl)nonanoyl]oxy})propoxy)phosphinic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | CCCC1=C(C)C(C)=C(CCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP(O)(=O)OCCN)OC(=O)CCCCCCCCC2=C(C)C(C)=C(CCC)O2)O1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C41H70NO10P/c1-7-21-36-31(3)33(5)38(51-36)23-17-13-9-11-15-19-25-40(43)47-29-35(30-49-53(45,46)48-28-27-42)50-41(44)26-20-16-12-10-14-18-24-39-34(6)32(4)37(52-39)22-8-2/h35H,7-30,42H2,1-6H3,(H,45,46)/t35-/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | JZTBVIMTIWLPNI-PGUFJCEWSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | This compound belongs to the class of organic compounds known as phosphatidylethanolamines. These are glycerophosphoetahnolamines in which two fatty acids are bonded to the glycerol moiety through ester linkages. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Lipids and lipid-like molecules | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Glycerophospholipids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Glycerophosphoethanolamines | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Phosphatidylethanolamines | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents |
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Substituents |
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Molecular Framework | Aromatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physiological effect | Health effect
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Disposition | Biological location
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Process | Naturally occurring process
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Role | Biological role
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Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Molecular Properties |
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Experimental Chromatographic Properties | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Molecular Properties |
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Predicted Chromatographic Properties | Predicted Collision Cross Sections
Predicted Kovats Retention IndicesUnderivatized
Derivatized | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MS/MS Spectra
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biospecimen Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Normal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Abnormal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated Disorders and Diseases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease References | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMH ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MarkerDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Good Scents ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References |
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Only showing the first 10 proteins. There are 43 proteins in total.
Enzymes
- General function:
- Involved in phospholipase A2 activity
- Specific function:
- PA2 catalyzes the calcium-dependent hydrolysis of the 2-acyl groups in 3-sn-phosphoglycerides. This isozyme hydrolyzes more efficiently L-alpha-1-palmitoyl-2-oleoyl phosphatidylcholine than L-alpha-1-palmitoyl-2-arachidonyl phosphatidylcholine, L-alpha-1-palmitoyl-2-arachidonyl phosphatidylethanolamine, or L-alpha-1-stearoyl-2-arachidonyl phosphatidylinositol. May be involved in the production of lung surfactant, the remodeling or regulation of cardiac muscle.
- Gene Name:
- PLA2G5
- Uniprot ID:
- P39877
- Molecular weight:
- 15674.065
- General function:
- Involved in phospholipase A2 activity
- Specific function:
- PA2 catalyzes the calcium-dependent hydrolysis of the 2-acyl groups in 3-sn-phosphoglycerides. Hydrolyzes phosphatidylglycerol versus phosphatidylcholine with a 15-fold preference.
- Gene Name:
- PLA2G2F
- Uniprot ID:
- Q9BZM2
- Molecular weight:
- 23256.29
- General function:
- Involved in metabolic process
- Specific function:
- Selectively hydrolyzes arachidonyl phospholipids in the sn-2 position releasing arachidonic acid. Together with its lysophospholipid activity, it is implicated in the initiation of the inflammatory response.
- Gene Name:
- PLA2G4A
- Uniprot ID:
- P47712
- Molecular weight:
- 85210.19
- General function:
- Involved in phospholipase A2 activity
- Specific function:
- PA2 catalyzes the calcium-dependent hydrolysis of the 2-acyl groups in 3-sn-phosphoglycerides.
- Gene Name:
- PLA2G1B
- Uniprot ID:
- P04054
- Molecular weight:
- 16359.535
- General function:
- Involved in phospholipase A2 activity
- Specific function:
- Not known; does not seem to have catalytic activity.
- Gene Name:
- PLA2G12B
- Uniprot ID:
- Q9BX93
- Molecular weight:
- Not Available
- General function:
- Involved in phospholipase A2 activity
- Specific function:
- PA2 catalyzes the calcium-dependent hydrolysis of the 2-acyl groups in 3-sn-phosphoglycerides. Has a powerful potency for releasing arachidonic acid from cell membrane phospholipids. Prefers phosphatidylethanolamine and phosphatidylcholine liposomes to those of phosphatidylserine.
- Gene Name:
- PLA2G10
- Uniprot ID:
- O15496
- Molecular weight:
- 18153.04
- General function:
- Involved in phospholipase A2 activity
- Specific function:
- PA2 catalyzes the calcium-dependent hydrolysis of the 2-acyl groups in 3-sn-phosphoglycerides. Has a preference for arachidonic-containing phospholipids.
- Gene Name:
- PLA2G2E
- Uniprot ID:
- Q9NZK7
- Molecular weight:
- 15988.525
- General function:
- Involved in metabolic process
- Specific function:
- Catalyzes the release of fatty acids from phospholipids. It has been implicated in normal phospholipid remodeling, nitric oxide-induced or vasopressin-induced arachidonic acid release and in leukotriene and prostaglandin production. May participate in fas mediated apoptosis and in regulating transmembrane ion flux in glucose-stimulated B-cells. Has a role in cardiolipin (CL) deacylation. Required for both speed and directionality of monocyte MCP1/CCL2-induced chemotaxis through regulation of F-actin polymerization at the pseudopods. Isoform ankyrin-iPLA2-1 and isoform ankyrin-iPLA2-2, which lack the catalytic domain, are probably involved in the negative regulation of iPLA2 activity.
- Gene Name:
- PLA2G6
- Uniprot ID:
- O60733
- Molecular weight:
- 84092.635
- General function:
- Involved in phospholipase A2 activity
- Specific function:
- PA2 catalyzes the calcium-dependent hydrolysis of the 2-acyl groups in 3-sn-phosphoglycerides. L-alpha-1-palmitoyl-2-linoleoyl phosphatidylethanolamine is more efficiently hydrolyzed than the other phospholipids examined.
- Gene Name:
- PLA2G2D
- Uniprot ID:
- Q9UNK4
- Molecular weight:
- 16546.1
- General function:
- Involved in protein binding
- Specific function:
- May have a role in signal-induced cytoskeletal regulation and/or endocytosis (By similarity).
- Gene Name:
- PLD2
- Uniprot ID:
- O14939
- Molecular weight:
- 104656.485
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