Showing metabocard for DG(2:0/0:0/20:4(5Z,8Z,10E,14Z)-OH(12S)) (HMDB0296893)
Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 5.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Predicted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2021-09-19 04:53:03 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-11-30 20:10:07 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0296893 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | DG(2:0/0:0/20:4(5Z,8Z,10E,14Z)-OH(12S)) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | DG(2:0/0:0/20:4(5Z,8Z,10E,14Z)-OH(12S)) belongs to the class of organic compounds known as other hydroxyeicosapolyenoic acids. These are hydroxyeicosapolyenoic acids which do not belong to the Hydroxyeicosapentaenoic acids, the Hydroxyeicosatetraenoic acids, or the Hydroxyeicosatrienoic acids. Based on a literature review very few articles have been published on DG(2:0/0:0/20:4(5Z,8Z,10E,14Z)-OH(12S)). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C25H40O6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 436.589 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 436.282489008 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | (2R)-3-(acetyloxy)-2-hydroxypropyl (5Z,8Z,10E,12R,14Z)-12-hydroxyicosa-5,8,10,14-tetraenoate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | (2R)-3-(acetyloxy)-2-hydroxypropyl (5Z,8Z,10E,12R,14Z)-12-hydroxyicosa-5,8,10,14-tetraenoate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | CCCCC\C=C/C[C@@H](O)\C=C\C=C/C\C=C/CCCC(=O)OC[C@H](O)COC(C)=O | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C25H40O6/c1-3-4-5-6-11-14-17-23(27)18-15-12-9-7-8-10-13-16-19-25(29)31-21-24(28)20-30-22(2)26/h8-12,14-15,18,23-24,27-28H,3-7,13,16-17,19-21H2,1-2H3/b10-8-,12-9-,14-11-,18-15+/t23-,24-/m1/s1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | TUNSOBFHDFHXOD-AUZQWMQVSA-N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as other hydroxyeicosapolyenoic acids. These are hydroxyeicosapolyenoic acids which do not belong to the Hydroxyeicosapentaenoic acids, the Hydroxyeicosatetraenoic acids, or the Hydroxyeicosatrienoic acids. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Lipids and lipid-like molecules | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Fatty Acyls | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Eicosanoids | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Other hydroxyeicosapolyenoic acids | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physiological effect | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disposition | Source
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Process | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Role | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Molecular Properties |
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Experimental Chromatographic Properties | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Molecular Properties |
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Predicted Chromatographic Properties | Predicted Collision Cross Sections
Predicted Kovats Retention IndicesNot Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biospecimen Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways |
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Normal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Abnormal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated Disorders and Diseases | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease References | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 157005000 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMH ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MarkerDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Good Scents ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References | Not Available |
Only showing the first 10 proteins. There are 132 proteins in total.
Enzymes
- General function:
- Involved in diacylglycerol kinase activity
- Specific function:
- Phosphorylates diacylglycerol (DAG) to generate phosphatidic acid (PA). May regulate the activity of protein kinase C by controlling the balance between these two signaling lipids. Activated in the nucleus in response to alpha-thrombin and nerve growth factor. May be involved in cAMP- induced activation of NR5A1 and subsequent steroidogenic gene transcription by delivering PA as ligand for NR5A1. Acts synergistically with NR5A1 on CYP17 transcriptional activity
- Gene Name:
- DGKQ
- Uniprot ID:
- P52824
- Molecular weight:
- 101154.0
- General function:
- Involved in catalytic activity
- Specific function:
- Not Available
- Gene Name:
- PNLIP
- Uniprot ID:
- P16233
- Molecular weight:
- 51156.48
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes.
- Gene Name:
- PLCB1
- Uniprot ID:
- Q9NQ66
- Molecular weight:
- 138565.805
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes. This form has a role in retina signal transduction.
- Gene Name:
- PLCB4
- Uniprot ID:
- Q15147
- Molecular weight:
- 136105.065
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes.
- Gene Name:
- PLCB2
- Uniprot ID:
- Q00722
- Molecular weight:
- 134023.21
- General function:
- Involved in diacylglycerol kinase activity
- Specific function:
- Reverses the normal flow of glycerolipid biosynthesis by phosphorylating diacylglycerol back to phosphatidic acid
- Gene Name:
- DGKG
- Uniprot ID:
- P49619
- Molecular weight:
- 89095.3
- General function:
- Involved in catalytic activity
- Specific function:
- Hepatic lipase has the capacity to catalyze hydrolysis of phospholipids, mono-, di-, and triglycerides, and acyl-CoA thioesters. It is an important enzyme in HDL metabolism. Hepatic lipase binds heparin.
- Gene Name:
- LIPC
- Uniprot ID:
- P11150
- Molecular weight:
- 55914.1
- General function:
- Involved in lipid metabolic process
- Specific function:
- Crucial for the intracellular hydrolysis of cholesteryl esters and triglycerides that have been internalized via receptor-mediated endocytosis of lipoprotein particles. Important in mediating the effect of LDL (low density lipoprotein) uptake on suppression of hydroxymethylglutaryl-CoA reductase and activation of endogenous cellular cholesteryl ester formation.
- Gene Name:
- LIPA
- Uniprot ID:
- P38571
- Molecular weight:
- 45418.71
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes.
- Gene Name:
- PLCB3
- Uniprot ID:
- Q01970
- Molecular weight:
- 138797.725
- General function:
- Involved in catalytic activity
- Specific function:
- May function as inhibitor of dietary triglyceride digestion. Lacks detectable lipase activity towards triglycerides, diglycerides, phosphatidylcholine, galactolipids or cholesterol esters (in vitro) (By similarity).
- Gene Name:
- PNLIPRP1
- Uniprot ID:
- P54315
- Molecular weight:
- Not Available
Transporters
- General function:
- Lipid transport and metabolism
- Specific function:
- Involved in translocation of long-chain fatty acids (LFCA) across the plasma membrane. The LFCA import appears to be hormone-regulated in a tissue-specific manner. In adipocytes, but not myocytes, insulin induces a rapid translocation of FATP1 from intracellular compartments to the plasma membrane, paralleled by increased LFCA uptake. May act directly as a bona fide transporter, or alternatively, in a cytoplasmic or membrane- associated multimeric protein complex to trap and draw fatty acids towards accumulation. Plays a pivotal role in regulating available LFCA substrates from exogenous sources in tissues undergoing high levels of beta-oxidation or triglyceride synthesis. May be involved in regulation of cholesterol metabolism. Has acyl-CoA ligase activity for long-chain and very-long-chain fatty acids
- Gene Name:
- SLC27A1
- Uniprot ID:
- Q6PCB7
- Molecular weight:
- 71107.5
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